GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-03-24

代謝組學(xué)尿液樣本收集:1)取空腹晨尿、中段尿(臨床)或晨間1 h尿(動(dòng)物)于50 mL離心管中;2)4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清,用1.5 mL離心管分裝,保存于-80 ℃。3)動(dòng)物1 h尿量不夠的情況下,可分多次收集尿液;如需收取24 h尿液,需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集,并且及時(shí)凍存樣本。4)收集完尿液樣本后,建議使用液氮淬滅15 min后,再分裝多管后于-80 ℃凍存。組織樣本收集:動(dòng)物組織(包括腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉和皮膚等;軟體動(dòng)物如血吸蟲):1)取適量組織,用預(yù)冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈;2)迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y(jié)締組織,再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈;3)用干凈的無塵吸水紙吸干水分,將組織分成50-100 mg / 管分裝待用;4)管子上做好標(biāo)記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存;干冰運(yùn)輸。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),有以下幾個(gè)方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此,一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前,先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測,確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3)后期數(shù)據(jù)矯正,特別是對于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個(gè)樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時(shí),使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正。北京農(nóng)學(xué)靶向代謝組學(xué)技術(shù)分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。

代謝組學(xué)樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時(shí)間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機(jī)中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。

選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少,大約在103個(gè)數(shù)量級,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,分析起來更簡單明了。代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜?;蚝偷鞍踪|(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。代謝組學(xué)主要研究的是各種代謝路徑的底物。

代謝組學(xué)研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進(jìn)行更深入的研究。代謝組學(xué)研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。廣州LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析

商務(wù)服務(wù)的發(fā)展在一定程度上可以解決企業(yè)發(fā)展痛點(diǎn),能夠創(chuàng)造出良好的創(chuàng)業(yè)土壤,讓企業(yè)專注于重點(diǎn)主營業(yè)務(wù),剝離繁瑣的事務(wù)運(yùn)轉(zhuǎn)。商務(wù)服務(wù)也屬于共享經(jīng)濟(jì)的范疇,可以使企業(yè)共享資源和服務(wù),降低成本。銷售既可以把我們從書本上得來的知識學(xué)以致用,還能在物換星移的時(shí)空里激發(fā)我們對生命和世界的熱愛。正如銘刻在希臘圣城德爾斐神殿上的出名箴言——“人啊,認(rèn)識你自己”,在旅途中看到自己的內(nèi)心,生命也因此而豐盛。好的服務(wù)型能提升企業(yè)贏利能力和活力,營造人群的幸福感,增加人群粘性;但相反之,則可能讓人群產(chǎn)生厭拒心理。因?yàn)椋瑹o序過度的商業(yè),粗制濫造的產(chǎn)品,不僅僅是在欺瞞消費(fèi)人群,更是在消耗自身活力,所以這些服務(wù)型最終被市場淘汰。嚴(yán)格來說,無論是欣賞人文還是享受山水之樂,都離不開良好的有限責(zé)任公司(自然)服務(wù),好的有限責(zé)任公司(自然)服務(wù)總能讓人身心愉悅,更好地融入當(dāng)?shù)厣?,?chuàng)造出旅游記憶。GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析

上海拜譜生物科技有限公司致力于商務(wù)服務(wù),是一家服務(wù)型公司。公司業(yè)務(wù)分為多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于商務(wù)服務(wù)行業(yè)的發(fā)展。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高品質(zhì)服務(wù)體驗(yàn),為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。