代謝組學比較常用到的數據分析方法:代謝組學分析數據用于統(tǒng)計分析時,數據集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數,每一行表示一個樣品, K表示K個變量,每一列表示一個變量,在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內在聯(lián)系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數據對所測樣品的優(yōu)劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數變化大?。‵old Change,FC)表示實驗組與對照組的含量比值,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。代謝組學技術可應用于藥物毒理學。貴州LC-MS/MS非靶向代謝組學領域
代謝組學有哪些應用?近年來,代謝組學技術得到了迅速發(fā)展,主要可應用于:功能基因組學、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學、中醫(yī)藥現代化、植物代謝組學、微生物代謝組學、營養(yǎng)學、環(huán)境科學等生命科學的各個領域。為什么要選擇代謝組學?首先需要明確的是代謝組學的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產物,如糖、有機酸、脂質、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關注的是小分子物質,那么采用代謝組學的方法,可以對樣品內檢測到的小分子物質進行定性、定量分析。同于基因組學和蛋白組學,代謝組學的研究反映某一時刻下正在發(fā)生的生命活動情況,研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關系,能夠幫助尋找新的生物標記物,發(fā)現新的代謝途徑,以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑,應用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發(fā)現、疾病的病理生理研究。湖北個性化定制靶向代謝組學鑒定代謝組學技術得到了迅速發(fā)展。
GC-MS非靶向與代謝組學的關系?代謝組學是運用多種技術手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質等)的種類、數量及變化規(guī)律的科學,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統(tǒng)全方面的分析平臺。氣相色譜-質譜聯(lián)用(GC-MS)技術因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現性好,擁有大量標準質譜圖數據庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學和分析技術的發(fā)展,運用GC-MS非靶向代謝組學研究疾病機制和發(fā)現藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現中提供重要參考和啟示。
代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內容物提取液等。一般代謝組學能檢測出多少物質?同的質譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質約200個左右,檢測尿液樣品定性的物質約200個左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內容物)也在幾百這個數量級。如果采用全二維GC/MS,物質的數量要更多,可達1千以上。LC/MS檢測物質的數量要遠比GC/MS多,但能準確定性和定量的不多,視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達到幾十至2-3百個物質。代謝組學的研究處于生物信息流的中游。
代謝組學的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據研究的對象和目的不同,科學家將生物體系的代謝產物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結構、性質相關的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內特定組織內的代謝產物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發(fā)展起來的一門學科。貴州LC-MS/MS非靶向代謝組學領域
什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?貴州LC-MS/MS非靶向代謝組學領域
代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存,-80度凍存;單個樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請咨詢譜領工作人員。貴州LC-MS/MS非靶向代謝組學領域
上海拜譜生物科技有限公司主要經營范圍是商務服務,擁有一支專業(yè)技術團隊和良好的市場口碑。公司業(yè)務涵蓋多組學服務,質譜檢測,蛋白質組學,代謝組學等,價格合理,品質有保證。公司秉持誠信為本的經營理念,在商務服務深耕多年,以技術為先導,以自主產品為重點,發(fā)揮人才優(yōu)勢,打造商務服務良好品牌。拜譜生物憑借創(chuàng)新的產品、專業(yè)的服務、眾多的成功案例積累起來的聲譽和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。