上海烈冰生物單細胞多組學測序服務

來源: 發(fā)布時間:2022-09-17

其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務,多組學聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。上海烈冰生物單細胞多組學測序服務

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。成都BD單細胞多組學服務機構(gòu)首先 出現(xiàn)的單細胞多組學方法就是將轉(zhuǎn)錄組與其他組學技術(shù)結(jié)合。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您!

未來,單細胞多組學測序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫手段、測序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學和物理等多學科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測到的一些重要的基因表達調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細胞多組學測序技術(shù)發(fā)展勢頭強勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細胞測序工具箱,各種組學方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用、成本低、可商業(yè)化的方法,并進一步擴大其實際應用范圍。單細胞多組學測序技術(shù)已應用于心肌再生領(lǐng)域。

BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細胞和射出的磁珠碰撞的過程,進行單細胞捕獲的技術(shù),轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù)。該技術(shù)用20萬+的微孔(該數(shù)量級遠大于Input細胞數(shù)量),保證單孔中的單細胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對),保證Input細胞的高效使用。對于Input細胞的量更少的情況,可以基于百萬級別的細胞總量開始進行前期處理以及后期捕獲操作。而在細胞捕獲完成后,進行細胞裂解后,同樣的也進行細胞中RNApolyA序列的抓取工作。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。青島BD Rhapsody單細胞多組學測序服務

單細胞多組學的研究對生物標志物的發(fā)現(xiàn),細胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。上海烈冰生物單細胞多組學測序服務

單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學分析等步驟.因此,單細胞多組學測序技術(shù)的發(fā)展也為相關(guān)算法的開發(fā)帶來了機遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計算方法不僅可以更好地進行細胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達調(diào)控網(wǎng)絡和解析細胞在組織中的空間位置等信息。多組學的聯(lián)合分析需要解決的計算問題是如何將大量單細胞產(chǎn)生的多種不同的組學數(shù)據(jù)進行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數(shù)據(jù)背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細胞多組學的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。上海烈冰生物單細胞多組學測序服務

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