重慶烈冰科技單細胞多組學商業(yè)化服務

來源: 發(fā)布時間:2022-09-16

RNA測序(RNA-seq)是轉錄組學研究的重要工具,也是生命科學領域常用的技術之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉錄組學有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結構以及在細胞生命活動中的重要調控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現細胞水平的變化信息。作為轉錄組學研究的技術基礎,RNA測序技術也在不斷地更新迭代,現如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。多組學技術結合了不同的生物數據集,如基因組學、轉錄組學和蛋白質組學。重慶烈冰科技單細胞多組學商業(yè)化服務

單細胞多組學測序技術的發(fā)展依賴于各種單一組學檢測技術的完善,但即使在單細胞測序技術迅速發(fā)展的情況下,在單細胞水平協同檢測多個不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學都有不同的特性和測量方法,這些方法在敏感性、特異性、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細胞水平對多種組學方法進行整合和應用時,需要在策略上做出改進,以保證各組學間的上游建庫以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時也要明確技術的局限性及其對研究結果的潛在影響。成都BD Rhapsody單細胞多組學測序服務公司以單細胞轉錄組為中心的多組學聯合分析有利于更好地理解基因變化與表型變化之間的關聯性。

當蜂巢孔內同時落入細胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入細胞裂解液對細胞進行裂解,使細胞內的RNA與磁珠上的標簽進行結合,完成每個細胞內RNA的捕獲和標記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進行回收,待所有質控結果確認通過后就可以進行后續(xù)的RNA反轉錄、cDNA第二鏈合成等實驗操作。而BDCartridge板則需要再進行一次成像,獲得磁珠收集后的掃描圖,判斷磁珠是否已經被有效收集。根據每一步的質控結果,烈冰科技(NovelBio)單細胞測序實驗團隊會根據單細胞分選的實驗結果生成實驗總結報告,判斷每一步驟是否通過質控,并得到捕獲的單細胞數量以及雙細胞比例,對整個實驗進行總結評估。若所有過程通過質控,實驗樣本即可進行下一步實驗操作。

基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區(qū)分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環(huán)數的增大會出現不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構建、高通量測序和生物信息學分析等步驟。

BD的技術不再采用利用微流控孔道射出細胞和射出的磁珠碰撞的過程,進行單細胞捕獲的技術,轉而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術。該技術用20萬+的微孔(該數量級遠大于Input細胞數量),保證單孔中的單細胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對),保證Input細胞的高效使用。對于Input細胞的量更少的情況,可以基于百萬級別的細胞總量開始進行前期處理以及后期捕獲操作。而在細胞捕獲完成后,進行細胞裂解后,同樣的也進行細胞中RNApolyA序列的抓取工作。利用單細胞多組學技術能夠更有效地研究細 胞在特定時空狀態(tài)下各組學間的復雜聯系。深圳BD單細胞多組學測序服務

隨著組學新技術的不斷涌現,高通量的方向發(fā)展,通過對多組學數據的整合分析,已成為科研究新方向。重慶烈冰科技單細胞多組學商業(yè)化服務

當下,單細胞測序已經廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件,如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展,以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術,其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么?免疫研究中,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,這樣PDL1-PD1的關系會生效么?重慶烈冰科技單細胞多組學商業(yè)化服務

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