成都烈冰科技單細胞多組學測序服務公司

來源: 發(fā)布時間:2022-09-15

FluidigmC1平臺基于富魯達(Fluidigm®)的微流控技術應用于單細胞測序(SingleCellRNASequencing)領域的商業(yè)化中,該技術大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,進行各類的Single-Cell測序建庫。當然,通量還是比較小。但不可否認的是,現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測序,仍然在采用這樣的技術,如SingleCellDNA-Seq,SingleCellATAC-Seq等,都是采用此技術進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10XGenomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測序技術之前,C1仍然會是市場上的重要組成部分。為了能深入分析和理解細胞狀態(tài)和命運決定的機制, 將單細胞各組學技術結合在一起的單細胞多組學技術產(chǎn)生。成都烈冰科技單細胞多組學測序服務公司

BD的技術不再采用利用微流控孔道射出細胞和射出的磁珠碰撞的過程,進行單細胞捕獲的技術,轉而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術。該技術用20萬+的微孔(該數(shù)量級遠大于Input細胞數(shù)量),保證單孔中的單細胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對),保證Input細胞的高效使用。對于Input細胞的量更少的情況,可以基于百萬級別的細胞總量開始進行前期處理以及后期捕獲操作。而在細胞捕獲完成后,進行細胞裂解后,同樣的也進行細胞中RNApolyA序列的抓取工作。重慶BD Rhapsody單細胞多組學平臺烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。

如在現(xiàn)有研究方法基礎上,進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學、相互作用蛋白質(zhì)組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展,單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細胞通量、空間分辨率以及多組學的兼容能力會不斷突破我們的認知極限。更重要的是,單細胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用將會越來越大。

BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng),可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數(shù)。在進行質(zhì)量評估之前,首先要將細胞的培養(yǎng)體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中,需要進行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉子離心機來進行這步操作。這種離心機可以有效減少細胞在多次更換Buffer過程中的損失,尤其是對于細胞量較少的樣本來說,顯得非常有必要。更換完Buffer之后,還需要將細胞進行過篩操作,去除較大的細胞團,獲得較為純凈的單細胞懸液。單細胞多組學測序技術整合了單細胞各個組學特征, 提供了揭示細胞內(nèi)復雜分子調(diào)控網(wǎng)絡及其互動關系的機會。

空間轉錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學過程。針對任何一個基因,空間轉錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布;單細胞轉錄組可以給出該基因表達的細胞類群;原位測序可以給出該基因在細胞內(nèi)的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較,可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異,給出其在細胞內(nèi)的真實的演變狀況。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。重慶BD Rhapsody單細胞多組學平臺

在單細胞轉錄組領域,將轉錄組與蛋白質(zhì)結合的代表性例子只有單細 胞RNA測序方法。成都烈冰科技單細胞多組學測序服務公司

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞轉錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構,無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息,在保留組織形態(tài)結構的基礎上,獲得細胞/基因的空間表達特異性。成都烈冰科技單細胞多組學測序服務公司

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