對于單細胞測序而言，常常需要先構(gòu)建細胞圖譜，在此基礎上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別是目的為圖譜研究時，需要通過提高樣本復雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此，單細胞測序?qū)嶒炘O計時首先需要保證生物學重復，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù)，單個樣本分別捕獲細胞時，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準確性。單細胞轉(zhuǎn)錄組技術在多個研究領域都發(fā)揮了重要的推進作用，揭示了組織中微量的細胞類型和基因表達特征。廣州單細胞多組學多組學測序
單細胞多組學測序技術的發(fā)展依賴于各種單一組學檢測技術的完善,但即使在單細胞測序技術迅速發(fā)展的情況下,在單細胞水平協(xié)同檢測多個不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學都有不同的特性和測量方法,這些方法在敏感性、特異性、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細胞水平對多種組學方法進行整合和應用時,需要在策略上做出改進,以保證各組學間的上游建庫以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時也要明確技術的局限性及其對研究結(jié)果的潛在影響。蘇州single cell 單細胞多組學單細胞多組學對不同組學技術產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進行整合分析有助于更刻畫細胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機制。
BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng)，可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數(shù)。在進行質(zhì)量評估之前，首先要將細胞的培養(yǎng)體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中，需要進行多次離心、重懸操作，烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機來進行這步操作。這種離心機可以有效減少細胞在多次更換Buffer過程中的損失，尤其是對于細胞量較少的樣本來說，顯得非常有必要。更換完Buffer之后，還需要將細胞進行過篩操作，去除較大的細胞團，獲得較為純凈的單細胞懸液。
單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽，需要對細胞數(shù)量、細胞活性進行準確判斷，這對SingleCell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計數(shù)偏低，則會顯著提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式，來對應各種不同的操作。通過已經(jīng)設定的程序來控制液體的流速，大幅度降低人為操作習慣帶來的差異，保證實驗操作的一致性。單細胞多組學數(shù)據(jù)整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學的特征空間存在差異。
烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動，并繪制活動發(fā)生的位置，這將有助于科學家更好地構(gòu)建生物圖譜，并進一步理解疾病和生物學過程。目前，空間轉(zhuǎn)錄組主要應用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業(yè)的實驗團隊、豐富的切片經(jīng)驗，配置了國際主流的儀器設備，實驗團隊針對不同組織類型優(yōu)化完善實驗方案，并制定了嚴謹規(guī)范的實驗室SOP流程，保證空間轉(zhuǎn)錄組切片的質(zhì)量，全優(yōu)保障測序數(shù)據(jù)質(zhì)量。烈冰生物為您提供一站式全流程單細胞測序服務。北京高通量測序單細胞多組學測序
單細胞多組學技術可在同一細胞中捕獲分析兩種以上的組學信息,包括轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀基因組、蛋白組等。廣州單細胞多組學多組學測序
烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。廣州單細胞多組學多組學測序
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