您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，首先，該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù)，因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問(wèn)題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失；其次，BDRhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無(wú)電子元件，便于攜帶，當(dāng)您的樣本需及時(shí)實(shí)驗(yàn)時(shí)，我們可以“拎包上門(mén)”，快速的完成細(xì)胞捕獲部分，不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來(lái)的損失；在這，BDRhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對(duì)細(xì)胞數(shù)量包容性較好，細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul，針對(duì)樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類(lèi)型，也能完成整個(gè)項(xiàng)目的細(xì)胞捕獲工作。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)，烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案。陜西BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性，針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本，采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞，基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。重慶BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序2019年，烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類(lèi)文章。
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專(zhuān)業(yè)的生信代碼交給專(zhuān)業(yè)的烈冰，專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)意義交給專(zhuān)業(yè)的您，詳情請(qǐng)咨詢烈冰生物。
多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！強(qiáng)勢(shì)發(fā)文！烈冰BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。
什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài)，失真嚴(yán)重，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時(shí)，盡可能提供足量的細(xì)胞，以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題，BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低，一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣，為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具。BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序
此外，烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案，歡迎垂詢。陜西BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí)，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。陜西BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
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