未來,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫(kù)手段、測(cè)序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)流程以及提升實(shí)驗(yàn)效率.為了更好地檢測(cè)到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學(xué)和物理等多學(xué)科中尋找解決方案.此外,新的計(jì)算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實(shí)驗(yàn)限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時(shí)序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細(xì)胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測(cè)到的一些重要的基因表達(dá)調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)發(fā)展勢(shì)頭強(qiáng)勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細(xì)胞測(cè)序工具箱,各種組學(xué)方法百家爭(zhēng)鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用、成本低、可商業(yè)化的方法,并進(jìn)一步擴(kuò)大其實(shí)際應(yīng)用范圍。單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)(single-cell multimodal omics) 是指在同一細(xì)胞中同時(shí)測(cè)量多種組學(xué)數(shù)據(jù)的前沿技術(shù)。深圳上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)
相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題，10X平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測(cè)序細(xì)胞量，這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，這兩種技術(shù)對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來說，都會(huì)更實(shí)用。同時(shí)依托Random Cell Label技術(shù)，使得其對(duì)于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象，相對(duì)于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測(cè)試結(jié)果，顯示無影響。廈門single cell 單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)基于單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)和高通量組學(xué)方法發(fā)展而來,能在單細(xì)胞分辨率下同時(shí)整合多種組學(xué)信息。
烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國(guó)際前沿、整合添加多項(xiàng)國(guó)際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果，詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后，就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進(jìn)行Spot的Cluster的過程，熟悉單細(xì)胞測(cè)序的研究者知道，Cluster在單細(xì)胞測(cè)序中往往表示為細(xì)胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype（當(dāng)然分情況也會(huì)有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性，導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型，而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。
烈冰科技作為國(guó)內(nèi)同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測(cè)BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫(kù)方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái)，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì)，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù)。
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！分子檢測(cè)型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)中也有一些集 中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。廈門烈冰單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化
單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組，擴(kuò)展到了基因組、免疫組、蛋白組等多組學(xué)水平。深圳上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)
二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測(cè)序”（sequencingbysynthesis）和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)（massiveparallelanalysis,MPS），使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升，烈冰生物斥巨資購(gòu)置的Novaseq6000測(cè)序儀的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步：樣品文庫(kù)構(gòu)建、簇生成、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長(zhǎng)限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3和5端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn)；3）Primerbindingsite，用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。深圳上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)
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