青島BD Rhapsody單細胞多組學技術支持

來源: 發(fā)布時間:2022-08-23

如在現有研究方法基礎上,進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質組學、相互作用蛋白質組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現。隨著基于單細胞蛋白質組學質譜研究方法的不斷發(fā)展,單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質的覆蓋度、細胞通量、空間分辨率以及多組學的兼容能力會不斷突破我們的認知極限。更重要的是,單細胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用將會越來越大。單細胞多組學 測序技術會轉向研發(fā)多組學測序分析和功能驗證同時 進行的方法。青島BD Rhapsody單細胞多組學技術支持

單細胞多組學測序技術的發(fā)展依賴于各種單一組學檢測技術的完善,但即使在單細胞測序技術迅速發(fā)展的情況下,在單細胞水平協同檢測多個不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學都有不同的特性和測量方法,這些方法在敏感性、特異性、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細胞水平對多種組學方法進行整合和應用時,需要在策略上做出改進,以保證各組學間的上游建庫以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時也要明確技術的局限性及其對研究結果的潛在影響。成都single cell 單細胞多組學技術支持單一的轉錄本研究不能體現生命進程的變化,因此多組學聯合分析成為解析生命進程的有力工具。

單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構建、高通量測序和生物信息學分析等步驟.因此,單細胞多組學測序技術的發(fā)展也為相關算法的開發(fā)帶來了機遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計算方法不僅可以更好地進行細胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達調控網絡和解析細胞在組織中的空間位置等信息。多組學的聯合分析需要解決的計算問題是如何將大量單細胞產生的多種不同的組學數據進行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數據背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細胞多組學的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。

分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集中于探究單細胞內表觀遺傳組各層面的變化及關聯。功能研究型單細胞多組學測序技術,結合了強大的CRISPR基因編輯技術,從而可以深度挖掘基因表達調控與細胞功能以及命運決定之間的因果關系。在未來,為了更系統地研究多層組學之間的互動關系對細胞命運的影響,一方面,單細胞多組學測序技術的策略會繼續(xù)向轉錄組結合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發(fā)展.另一方面,單細胞多組學測序技術會轉向研發(fā)多組學測序分析和功能驗證同時進行的方法,這種探究因果關系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關鍵因子和分子網絡模塊十分重要。單細胞多組學數據整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學的特征空間存在差異。

單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽,需要對細胞數量、細胞活性進行準確判斷,這對SingleCell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高,將會影響建庫的成功率;計數偏低,則會顯著提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數據的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。單細胞多學可包括基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學、影像組學。濟南烈冰科技單細胞多組學測序

單細胞多組學測序主要包含細胞分離、文庫構建、高通量測序和生物信息學分析等步驟。青島BD Rhapsody單細胞多組學技術支持

機體為響應各種應激,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時,往往會經歷轉錄重組,導致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構建細胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。青島BD Rhapsody單細胞多組學技術支持

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