重慶single cell 單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-22

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。隨著單細(xì)胞多組學(xué)的不斷進(jìn)步, 研究者將有機(jī)會(huì)在單細(xì)胞分辨率下進(jìn)一步理解個(gè)體發(fā)育以及疾病發(fā)展機(jī)制。重慶single cell 單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測(cè)序

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。西安BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)(single-cell multimodal omics) 是指在同一細(xì)胞中同時(shí)測(cè)量多種組學(xué)數(shù)據(jù)的前沿技術(shù)。

單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的發(fā)展依賴于各種單一組學(xué)檢測(cè)技術(shù)的完善,但即使在單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)迅速發(fā)展的情況下,在單細(xì)胞水平協(xié)同檢測(cè)多個(gè)不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學(xué)都有不同的特性和測(cè)量方法,這些方法在敏感性、特異性、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細(xì)胞水平對(duì)多種組學(xué)方法進(jìn)行整合和應(yīng)用時(shí),需要在策略上做出改進(jìn),以保證各組學(xué)間的上游建庫(kù)以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時(shí)也要明確技術(shù)的局限性及其對(duì)研究結(jié)果的潛在影響。

單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì):1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量;2. 不同層面表達(dá)水平分析,構(gòu)建表達(dá)“全景圖”;3. 多組學(xué)交叉驗(yàn)證:深層次挖掘其中調(diào)控機(jī)制;4. 對(duì)基因突變信息在蛋白水平上進(jìn)行驗(yàn)證;5.精細(xì)醫(yī)療:實(shí)現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,1. 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等;3. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型等;4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等;5. 微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;6. 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;7. 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;8.食品營(yíng)養(yǎng):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等。單細(xì)胞多組學(xué)對(duì)不同組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析有助于更刻畫細(xì)胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機(jī)制。

FluidigmC1平臺(tái)基于富魯達(dá)(Fluidigm®)的微流控技術(shù)應(yīng)用于單細(xì)胞測(cè)序(SingleCellRNASequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化中,該技術(shù)大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞,進(jìn)行各類的Single-Cell測(cè)序建庫(kù)。當(dāng)然,通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是,現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測(cè)序,仍然在采用這樣的技術(shù),如SingleCellDNA-Seq,SingleCellATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫(kù)。所以可以說,至少在10XGenomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測(cè)序技術(shù)之前,C1仍然會(huì)是市場(chǎng)上的重要組成部分。利用單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)能夠更有效地研究細(xì) 胞在特定時(shí)空狀態(tài)下各組學(xué)間的復(fù)雜聯(lián)系。溫州烈冰科技單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

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BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng),可以對(duì)不同熒光標(biāo)記的細(xì)胞進(jìn)行檢測(cè)并計(jì)數(shù)。在進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估之前,首先要將細(xì)胞的培養(yǎng)體系更換成上機(jī)所需的Buffer。在這個(gè)過程中,需要進(jìn)行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)來進(jìn)行這步操作。這種離心機(jī)可以有效減少細(xì)胞在多次更換Buffer過程中的損失,尤其是對(duì)于細(xì)胞量較少的樣本來說,顯得非常有必要。更換完Buffer之后,還需要將細(xì)胞進(jìn)行過篩操作,去除較大的細(xì)胞團(tuán),獲得較為純凈的單細(xì)胞懸液。重慶single cell 單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司。烈冰生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。烈冰生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。