為同時獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息，該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像，然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題，針對FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly（dA）序列進(jìn)行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針（RTL）與mRNA雜交。左側(cè)探針（LHS）具有部分Read 2序列，右側(cè)探針（RHS）具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接，而mRNA被RNase降解。組織透化后，被連接的成對探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT）序列的引物序列捕獲，并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進(jìn)行測序文庫構(gòu)建和測序。測序序列上的空間Barcode用于將測序序列定位到組織切片圖像上，UMI用于基因表達(dá)定量?？臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況，揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號通路。廈門烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控，做到從實驗設(shè)計、空間信息標(biāo)記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù)，助力高分文章發(fā)表；專業(yè)實驗團(tuán)隊保證樣本的高度一致性；專業(yè)的生物學(xué)團(tuán)隊提供個性化的產(chǎn)品應(yīng)用場景解讀、保持對生物學(xué)意義的關(guān)注；強大的生信分析團(tuán)隊一對一地進(jìn)行詳實科學(xué)的實驗方案設(shè)計并提供多次售后分析；可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍，-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進(jìn)行OCT包埋，或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標(biāo)明樣本方向，樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境廈門烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組平臺烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。
烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機(jī)，搭配切片經(jīng)驗豐富的實驗團(tuán)隊，可以提供一致性更高、實驗操作更精細(xì)的冷凍切片準(zhǔn)備方案，保持密切高效的溝通，設(shè)計更適合的實驗方案，確保每一個實驗細(xì)節(jié)有效進(jìn)行；烈冰升級配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng)，更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息，10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇，為不同大小的樣本提供更清晰的圖像，更精細(xì)的圖像信息采集、拼接策略，為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學(xué)提供更清晰的影像；
解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難，做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析；擁有行業(yè)先進(jìn)的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀，可以同時實現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像；Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴(kuò)展多層融合掃描模式，進(jìn)一步提升分辨率和清晰度，保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細(xì)采集；能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像，獲取表達(dá)與定位信息。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺。
空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù)，可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況，同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相?，空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像（H&E染?）與測序數(shù)據(jù)映射在?起，進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務(wù)。廈門烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組平臺
烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞捕獲，媲美國際主流的單細(xì)胞平臺。廈門烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值。然而，單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序，可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。廈門烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序價格
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊不斷壯大。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工，為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間，為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù)，深受員工與客戶好評。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括：單細(xì)胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨，深受客戶好評。一直以來公司堅持以客戶為中心、單細(xì)胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細(xì)胞多組學(xué)測序市場為導(dǎo)向，重信譽，保質(zhì)量，想客戶之所想，急用戶之所急，全力以赴滿足客戶的一切需要。