單細胞測序技術(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關鍵關卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領域收獲更多的成果。單細胞多組學技術可在同一細胞中捕獲分析兩種以上的組學信息,包括轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀基因組、蛋白組等。西安上海烈冰生物單細胞多組學平臺
從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“天花板”。寧波高通量測序單細胞多組學商業(yè)化服務單細胞多組學數(shù)據(jù)整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學的特征空間存在差異。
冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結構。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息??傮w來說,空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。
單細胞測序技術的不斷發(fā)展解決了以往群體細胞組學分析面臨的兩個瓶頸:一是大量細胞的混合測序會掩蓋細胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測序技術需要大量的細胞作為起始,細胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細胞測序方法不僅能夠揭示組織中的細胞類型和稀有亞群、細胞狀態(tài)和命運的變化,還可以研究細胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機制。隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學測序技術的快速發(fā)展,研究者開始將它們相互組合,使得單個細胞或同類細胞的多個組學數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細胞多組學技術能夠更有效地研究細胞在特定時空狀態(tài)下各組學間的復雜聯(lián)系,從而揭示細胞狀態(tài)和命運調(diào)控的分子機制。分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集 中于探究單細胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關聯(lián)。
當蜂巢孔內(nèi)同時落入細胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入細胞裂解液對細胞進行裂解,使細胞內(nèi)的RNA與磁珠上的標簽進行結合,完成每個細胞內(nèi)RNA的捕獲和標記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進行回收,待所有質(zhì)控結果確認通過后就可以進行后續(xù)的RNA反轉(zhuǎn)錄、cDNA第二鏈合成等實驗操作。而BDCartridge板則需要再進行一次成像,獲得磁珠收集后的掃描圖,判斷磁珠是否已經(jīng)被有效收集。根據(jù)每一步的質(zhì)控結果,烈冰科技(NovelBio)單細胞測序?qū)嶒瀳F隊會根據(jù)單細胞分選的實驗結果生成實驗總結報告,判斷每一步驟是否通過質(zhì)控,并得到捕獲的單細胞數(shù)量以及雙細胞比例,對整個實驗進行總結評估。若所有過程通過質(zhì)控,實驗樣本即可進行下一步實驗操作。單細胞多組學技術(single-cell multimodal omics) 是指在同一細胞中同時測量多種組學數(shù)據(jù)的前沿技術。濟南scRNA單細胞多組學技術支持
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reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導致基因中位數(shù)下降。而某一疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1萬,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。西安上海烈冰生物單細胞多組學平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主要經(jīng)營范圍是醫(yī)藥健康,擁有一支專業(yè)技術團隊和良好的市場口碑。公司業(yè)務分為單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序等,目前不斷進行創(chuàng)新和服務改進,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設計、強大的技術,還有一批專業(yè)化的隊伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務為榮、創(chuàng)意為先、技術為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。