蘇州BD空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-09

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動(dòng)圖先人一步:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況??臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號(hào)通路。蘇州BD空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!杭州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力生命健康醫(yī)療大時(shí)代!

烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機(jī),搭配切片經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì),可以提供一致性更高、實(shí)驗(yàn)操作更精細(xì)的冷凍切片準(zhǔn)備方案,保持密切高效的溝通,設(shè)計(jì)更適合的實(shí)驗(yàn)方案,確保每一個(gè)實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)有效進(jìn)行;烈冰升級(jí)配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng),更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息,10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇,為不同大小的樣本提供更清晰的圖像,更精細(xì)的圖像信息采集、拼接策略,為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學(xué)提供更清晰的影像;

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,上海烈冰生物科技很靠譜。

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對(duì)于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細(xì)胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個(gè)人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對(duì)生物體組織間的細(xì)胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍(lán)區(qū)胚胎發(fā)育的動(dòng)態(tài)過(guò)程是科研人員一直為之著迷的,空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍(lán)圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測(cè)試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞捕獲,媲美國(guó)際主流的單細(xì)胞平臺(tái)。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

烈冰一站式多平臺(tái)測(cè)序服務(wù):立足科學(xué)研究,解碼生命本質(zhì)。蘇州BD空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問(wèn)題,針對(duì)FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案無(wú)法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly(dA)序列進(jìn)行mRNA捕獲。該方案采用針對(duì)編碼基因的成對(duì)RNA模板連接探針(RTL)與mRNA雜交。左側(cè)探針(LHS)具有部分Read 2序列,右側(cè)探針(RHS)具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接,而mRNA被RNase降解。組織透化后,被連接的成對(duì)探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT)序列的引物序列捕獲,并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對(duì)探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進(jìn)行測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序。測(cè)序序列上的空間Barcode用于將測(cè)序序列定位到組織切片圖像上,UMI用于基因表達(dá)定量。蘇州BD空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。一批專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動(dòng)力。誠(chéng)實(shí)、守信是對(duì)企業(yè)的經(jīng)營(yíng)要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則。公司致力于打造***的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),我們相信誠(chéng)實(shí)正直、開拓進(jìn)取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個(gè)人帶來(lái)共同的利益和進(jìn)步。經(jīng)過(guò)幾年的發(fā)展,已成為單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序行業(yè)出名企業(yè)。