截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇，從平臺應(yīng)用比例來看，應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇，IF大于10分以上文章占比高達68.5%，烈冰專屬單細胞測序服務(wù)團隊，將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。廣州10X Chromium X單細胞測序平臺
10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制，微流體通道的直徑約為50~60um，因此捕獲細胞的直徑不能超過40um。當(dāng)細胞直徑過大時，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言，準(zhǔn)備采用單細胞技術(shù)用于課題研究的時候，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標(biāo)細胞，例如神經(jīng)元細胞、成熟心肌細胞由于體積過大，不適用于10X單細胞技術(shù)。其中神經(jīng)元細胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細胞直徑低于50um，但是成熟心肌細胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實驗失敗，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細胞文章，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了，主要還是因為未發(fā)育成熟的心肌細胞比較小，不會出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險。因此可以考慮組織解離后過40um濾網(wǎng)，過濾掉大細胞，避免出現(xiàn)管道堵塞、實驗失敗的風(fēng)險。此種方案的缺點是大細胞被過濾掉，丟失相關(guān)細胞數(shù)據(jù)；另外組織解離獲得高質(zhì)量細胞懸液以后，繼續(xù)做細胞裂解抽細胞核，開展細胞核測序。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細解答。天津10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺烈冰開展了單細胞轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。
細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細胞/基因的空間表達特異性。
從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細胞類型的功能解析，越來越需要一種多組學(xué)的細胞生物學(xué)視角。通過單細胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列（包括T細胞和B細胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù)，研究人員的獲益更多，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時間）。強勢發(fā)文！烈冰單細胞測序助力揭示愈傷組織能再生的機制。
多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！單細胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。天津10X Genomics單細胞測序服務(wù)機構(gòu)
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上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù)，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司，是一家集研發(fā)、設(shè)計、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提供高質(zhì)量的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺，以應(yīng)用為重點，以服務(wù)為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時代，對自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。