杭州BD單細(xì)胞多組學(xué)測序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-21

關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的,因此,必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。杭州BD單細(xì)胞多組學(xué)測序

現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣,每一個(gè)細(xì)胞都會結(jié)合一個(gè)磁珠,那么在每一個(gè)磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個(gè)抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。BD Rhapsody單細(xì)胞平臺烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺和自主研發(fā)國產(chǎn)化實(shí)驗(yàn)平臺。

您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對細(xì)胞的捕獲沒有偏好性,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個(gè)微孔板中容納了22萬+個(gè)微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000,至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無限稀釋過程,但22萬+微孔的存在,也對大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲(單個(gè)微孔板),滿足您的多重需求。

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細(xì)胞測序服務(wù)。

針對單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。十二年測序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。BD Rhapsody單細(xì)胞平臺

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烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制,如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率(雙細(xì)胞率)。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量,并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ;在細(xì)胞裂解前的步驟中評估細(xì)胞活性;并對通過測序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息,在進(jìn)行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤。杭州BD單細(xì)胞多組學(xué)測序

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