單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單，不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。過去的十年，我們是知識(shí)的承載者；現(xiàn)在，我們?cè)谂?gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時(shí)代；未來我們將重新定義知識(shí)形態(tài)！廣州10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬通量平臺(tái)
基于10X Geomics 動(dòng)態(tài)微流控技術(shù)，利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì)，形成短片段，單細(xì)胞ATAC測(cè)序在表觀基因組學(xué)水平上，揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題，區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性，獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破：分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開放區(qū)域，識(shí)別細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài)；識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動(dòng)細(xì)胞類型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列；探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段。合肥二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界。
一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲，小心得不償失，原因在這：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí)，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí)，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。
單細(xì)胞多組學(xué)提升見解 基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實(shí)視圖。烈冰2021年強(qiáng)勢(shì)引進(jìn)的10x Genomics Chromium單細(xì)胞平臺(tái)能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡(jiǎn)化了您需要開展的實(shí)驗(yàn)，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計(jì)算來推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過雙文庫構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。
現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺(tái)。在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別?，F(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引，就像生成測(cè)序文庫所涉及的流程步驟一樣。10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用動(dòng)態(tài)微流控技（Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理）。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái)。南京高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
單細(xì)胞測(cè)序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系，一度成為高通量測(cè)序技術(shù)的“天花板”。廣州10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬通量平臺(tái)
在政策促進(jìn)下，未來3—5年內(nèi)，我國將在醫(yī)藥健康短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才 培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺(tái)，培育一批品牌優(yōu)勢(shì)明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團(tuán)。健康科技行業(yè)前景光明。硅谷銀行聯(lián)合浦發(fā)硅谷銀行發(fā)布《健康科技：新興行業(yè)洞察》。該報(bào)告根據(jù)各有限責(zé)任公司（自然）公司的科技賦能解決方案將其歸類分組為醫(yī)藥機(jī)構(gòu)運(yùn)營、臨床試驗(yàn)賦能、醫(yī)藥導(dǎo)航、用藥管理、精神健康與醫(yī)藥教育六大領(lǐng)域，并對(duì)美國耗費(fèi)巨大的醫(yī)藥健康行業(yè)支出相關(guān)問題進(jìn)行分析，由此衡量收入和退出情況。加之生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場(chǎng)營銷策劃，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計(jì)算機(jī)、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】“兩票制”壓縮流通渠道層級(jí)，減少中間環(huán)節(jié)層層加價(jià)；反商業(yè)賄賂、稅務(wù)改進(jìn)等一系列政策的落地，迫使產(chǎn)業(yè)從不規(guī)范、低水平的商業(yè)化向規(guī)范的、高水平成熟的商業(yè)化進(jìn)化。新增內(nèi)容體現(xiàn)了我國醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)技術(shù)升級(jí)的方向，有助于引導(dǎo)企業(yè)緊跟國際前沿技術(shù)，加快開發(fā)具有國際競(jìng)爭(zhēng)力的新產(chǎn)品，提高產(chǎn)業(yè)化水平。既是單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序當(dāng)前發(fā)展的重要方向，也是我國重視中醫(yī)藥傳承與創(chuàng)新發(fā)展的重要體現(xiàn)。廣州10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序百萬通量平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢，擁有一支專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務(wù)，以誠信、敬業(yè)、進(jìn)取為宗旨，以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造產(chǎn)品為目標(biāo)，努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè)。公司堅(jiān)持以客戶為中心、生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場(chǎng)營銷策劃，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù)，計(jì)算機(jī)、軟件及耗材（除?？兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】市場(chǎng)為導(dǎo)向，重信譽(yù)，保質(zhì)量，想客戶之所想，急用戶之所急，全力以赴滿足客戶的一切需要。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序，堅(jiān)持“質(zhì)量保證、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針，贏得廣大客戶的支持和信賴。