10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，一列縱向孔道輸入細胞，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中。這時候，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。十二年測序經(jīng)驗，烈冰生物單細胞多組學領(lǐng)域的佼佼者。武漢10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經(jīng)過多年實戰(zhàn)，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗，實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒炂脚_，包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊，為您的科學研究保駕護航。吉林高通量測序單細胞測序服務公司搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺，5000+項目檢驗，真實可信賴。
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（Single Cell Browser），不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您！
針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質(zhì)量進行整體描述。過濾標準：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例，細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點，當存在多個斜率拐點的時候，結(jié)合預期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候，選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準；否則，選擇和預期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。全線搭建10x Genomics單細胞測序平臺。
二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencing by synthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massive parallel analysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3'和5'端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點；3）Primer binding site，用于結(jié)合PCR引物啟動擴增反應。過去的十年，我們是知識的承載者；現(xiàn)在，我們在努力構(gòu)建醫(yī)學的大數(shù)據(jù)時代；未來我們將重新定義知識形態(tài)！武漢10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建，實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。武漢10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構(gòu)建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。武漢10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司，是一家集研發(fā)、設(shè)計、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提?**的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導，以產(chǎn)品為平臺，以應用為重點，以服務為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場，以敏銳的市場洞察力，實現(xiàn)與客戶的成長共贏。