單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。全線搭建10x Genomics單細胞測序平臺。濟南單細胞測序技術(shù)支持
Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細胞?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細胞?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細胞?單細胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,如果單個細胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,直到幾個突破性技術(shù)的誕生。濟南單細胞測序烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程單細胞測序服務。
相對于Smart-Seq技術(shù)在細胞數(shù)量上的問題,10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術(shù)對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托Random Cell Label技術(shù),使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,顯示無影響。
Fluidigm C1平臺作為應用于單細胞測序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),基于富魯達(Fluidigm?)的微流控技術(shù),大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,進行各類的Single-Cell測序建庫。當然,通量還是比較小。但不可否認的是,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序,仍然在采用這樣的技術(shù),如Single Cell DNA-Seq,Single Cell ATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10X和BD,或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術(shù)之前,C1仍然會是市場上的重要組成部分。烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細胞測序新時代。
烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。濟南單細胞測序技術(shù)支持
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單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,100+組織類型解離protocol,精心設(shè)計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術(shù)以及死細胞過濾技術(shù),確保凍存組織使用。 珍貴樣本,細胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細胞? 采用國際認可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺模式,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分? 烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),真正做到從上游到下游的全流程檢測,確保超高的細胞分類精度。濟南單細胞測序技術(shù)支持
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