基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術，利用Tn5轉座酶酶切開放染色質(zhì)，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上，揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題，區(qū)分細胞異質(zhì)性，獲得開放染色質(zhì)的位置、轉錄因子的結合位點、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細胞表觀遺傳學的重要突破：分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域，識別細胞類型和細胞狀態(tài)；識別重要的轉錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列；探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。陜西10X Chromium X單細胞測序商業(yè)化服務
單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉化為cDNA進行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA，然后將其轉化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構建新一代測序文庫，從而測定整個轉錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點，并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點，而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉錄組基因表達分析。然而，這兩者只能提供細胞群體內(nèi)基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應容器中。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA，確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似，帶有條形碼的cDNA也被用于構建新一代測序文庫，從而能夠?qū)γ總€細胞的整個轉錄組進行基因表達測定。廣州二代測序單細胞測序服務過去的十年，我們是知識的承載者；現(xiàn)在，我們在努力構建醫(yī)學的大數(shù)據(jù)時代；未來我們將重新定義知識形態(tài)！
Single Cell Sequencing技術，即利用優(yōu)化后的高通量測序技術（NGS，Next Generation Sequencing）分析每一個單個細胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了，如何獲得單個細胞？如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個細胞？單個組織細胞群體通常在百萬級別以上，如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個細胞？單細胞測序成本非常高，尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候，如果單個細胞的分選成本也很高，技術根本無法普及。所以，正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足，直到幾個突破性技術的誕生。
科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應用于疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉化、惡性向轉移性的發(fā)展，以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么？基因測序相關產(chǎn)品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，是下一個改變世界的技術。
一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲，小心得不償失，原因在這：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當細胞捕獲數(shù)過多時，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù)，都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。青島二代測序單細胞測序
單細胞測序技術提供了單個細胞水平下的科學研究視角。陜西10X Chromium X單細胞測序商業(yè)化服務
單細胞多組學提升見解 基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處，因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息，那么單細胞多組學提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10x Genomics Chromium單細胞平臺能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學準確性，因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。陜西10X Chromium X單細胞測序商業(yè)化服務
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。公司自成立以來，以質(zhì)量為發(fā)展，讓匠心彌散在每個細節(jié)，公司旗下單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序深受客戶的喜愛。公司從事醫(yī)藥健康多年，有著創(chuàng)新的設計、強大的技術，還有一批專業(yè)化的隊伍，確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務。烈冰生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務、眾多的成功案例積累起來的聲譽和口碑，讓企業(yè)發(fā)展再上新高。