南京miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-11-30

逆轉(zhuǎn)錄是指以RNA為模板合成與其互補(bǔ)的cDNA的過程。逆轉(zhuǎn)錄PCR是將RNA的逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)相結(jié)合的技術(shù),故逆轉(zhuǎn)錄稱為RT-PCR或反轉(zhuǎn)錄PCR。逆轉(zhuǎn)錄PCR實(shí)驗(yàn)原理是,提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以RNA為模板,利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再以cDNA鏈為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而獲得大量拷貝。逆轉(zhuǎn)錄PCR的出現(xiàn)使RNA檢測的靈敏性提高了幾個(gè)數(shù)量級,使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:隨機(jī)引物法逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的片段較小,很難得到全長轉(zhuǎn)錄本的cDNA。單獨(dú)選擇某一種引物,實(shí)驗(yàn)可能都不完美,具體需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康膩泶_定。核酸合成與轉(zhuǎn)錄過程與遺傳信息的流動(dòng)方向相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄。南京miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)備工作:1、實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1)移液頭:200ul、10ul;(2)吸頭:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備,塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個(gè)浸泡于1‰DEPC水中(必要時(shí)小頭頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前將頭頭放入吸頭臺。3、試劑配制和準(zhǔn)備:(1)DEPC水:泡實(shí)驗(yàn)器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后備用。逆轉(zhuǎn)錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶內(nèi)裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,送至高壓,后分裝到幾個(gè)1。5mlEP管中,-20℃中保存?zhèn)溆谩#?)RT中所需要的各種試劑。重慶快速反轉(zhuǎn)錄制造商逆轉(zhuǎn)錄PCR在檢測病毒、診斷疾病等方面有普遍應(yīng)用。

人體中也有逆轉(zhuǎn)錄過程,比如端粒的復(fù)制。端粒(telomere)是染色體末端的特殊結(jié)構(gòu),由重復(fù)的DNA序列(TTAGGG)和核的蛋白組成,可以保護(hù)染色體末端,維持基因組完整性。端粒的末端是單鏈3'末端,形成一種緊湊的T環(huán)結(jié)構(gòu),可保持其穩(wěn)定性。其表面覆蓋著Shelterin復(fù)合物,包括TRF1(端粒重復(fù)結(jié)合因子1)、TRF2(端粒重復(fù)結(jié)合因子2)、TIN2(TRF1相互作用核的蛋白2)、RAP1(rif相關(guān)蛋白)、POT1(端粒保護(hù))和TPP1(端粒保護(hù)蛋白1)成功將人表皮干細(xì)胞體外分離培養(yǎng)的基礎(chǔ)上,對比觀察不同發(fā)育階段人表皮干細(xì)胞端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶表達(dá)的差異特征,結(jié)果表明人胚胎、少兒、成人皮膚來源的表皮干細(xì)胞均有端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶表達(dá),其表達(dá)強(qiáng)度依次減弱。提示誘導(dǎo)和增強(qiáng)端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶的表達(dá)對維持表皮干細(xì)胞在體外自我更新和增殖能力可能具有重要意義。

miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無酶水的體積和反應(yīng)溫度。高效的逆轉(zhuǎn)錄體系可提高反應(yīng)效率和檢測靈敏度。

加尾法逆轉(zhuǎn)錄的較大特點(diǎn)在于:對于抽提純化的miRNA,進(jìn)行無差別加尾。因此,如果用戶需要對樣本中的多個(gè)miRNA進(jìn)行考察,一次逆轉(zhuǎn)錄即可完成對所有qPCR模板的制備。qPCR引物方面,miRNA以及內(nèi)參的反向引物都是通用引物R,不同的只是正向引物。因此在設(shè)計(jì)加尾法miRNA的qPCR引物時(shí),只需設(shè)計(jì)特異性正向引物即可,正向引物的特異性直接決定了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的好壞??傊游卜ㄟm合對樣本中多個(gè)miRNA的快速檢測。引物設(shè)計(jì)簡單,但有非特異性的風(fēng)險(xiǎn)。由于其特殊的加PolyA機(jī)制,因此miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄是無法只通過常規(guī)的mRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒完成的。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)應(yīng)用于人類基因組的研究。南京miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

逆轉(zhuǎn)錄過程的揭示是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對中心法則的重要修正和補(bǔ)充。南京miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶比AMV反轉(zhuǎn)錄酶缺乏連續(xù)性,因此要獲得像AMV反轉(zhuǎn)錄酶反應(yīng)中產(chǎn)生同樣量的cDNA就要求使用較多單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶。用1微克的mRNA起始合成首先條鏈的cDNA,要用8單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶才相當(dāng)于1單位的AMV反轉(zhuǎn)錄酶的作用。該酶很容易被亞精胺(Spermidine)所抑制,該酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反轉(zhuǎn)錄酶5X反應(yīng)緩沖液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先條鏈緩沖液,因?yàn)檫@二種緩沖液均含有亞精胺。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染,逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程需適當(dāng)?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴(kuò)增效果。南京miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶