miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會形成二聚體時才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實驗需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無酶水的體積和反應(yīng)溫度。逆轉(zhuǎn)錄過程中的缺陷會導(dǎo)致錯誤擴增和偏差。北京加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶報價
逆轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)有重要的理論意義和實踐意義。(1)在致死病毒的研究中發(fā)現(xiàn)了病基因,在人類一些病細(xì)胞如膀胱病、小細(xì)胞肺病等細(xì)胞中,也分離出與病毒病基因相同的堿基序列,稱為細(xì)胞病基因或原病基因。病基因的發(fā)現(xiàn)為疙瘩發(fā)病機理的研究提供了很有前途的線索。(2)在實際工作中有助于基因工程的實施。由于目的基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物易于制備,可將mRNA反向轉(zhuǎn)錄形成DNA用以獲得目的基因。逆轉(zhuǎn)錄酶實驗操作注意事項:RNA提取一定要迅速,樣本要新鮮,組織盡量在液氮中研磨;RNA提取完馬上進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)過程,需建立無RNAase環(huán)境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的統(tǒng)稱,包含RNaseA,RNaseH等,RNaseA可以水解單雙鏈RNA,RNaseH主要水解RNA與DNA雜交雙鏈中的RNA。北京加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶報價逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達(dá)功能。
莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄是一種逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的技術(shù),它利用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子作為反向引物,在逆轉(zhuǎn)錄過程中特異性地擴增目標(biāo)RNA分子。該技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中得到了普遍的應(yīng)用,特別是在RNA的研究和檢測中具有獨特的優(yōu)勢。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的基本原理是利用逆轉(zhuǎn)錄酶和莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA作為反向引物,將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,并在PCR反應(yīng)中擴增。莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子具有較高的穩(wěn)定性和特異性,可以特異性地識別和結(jié)合目標(biāo)RNA分子,從而在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中作為反向引物擴增目標(biāo)cDNA。此外,由于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子與目標(biāo)RNA分子的堿基序列互補,因此莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以避免隨機引物引起的非特異擴增。
逆轉(zhuǎn)錄實驗步驟:用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行RT(20ul體積)1、準(zhǔn)備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、-20℃保存,或立即進(jìn)行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個區(qū)域起始,并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率,較大程度保證qPCR結(jié)果的真實性和可重復(fù)性。逆轉(zhuǎn)錄是一種將RNA反轉(zhuǎn)錄為DNA的生物化學(xué)過程。
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細(xì)胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細(xì)胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。逆轉(zhuǎn)錄實驗中可以通過qPCR檢測逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)效果。上海miQP2反轉(zhuǎn)錄純度高
逆轉(zhuǎn)錄實驗在反應(yīng)前應(yīng)將各反應(yīng)試劑混勻,避免試劑沉淀或剪切。北京加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶報價
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項,引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時,要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,所以對RNA樣品的質(zhì)量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng),建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設(shè)計引物時的下游引物做RT,引物設(shè)計質(zhì)量影響RT的結(jié)果,而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。北京加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶報價