反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項,隨機引物:適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達(dá)量很低)。選擇隨機引物時,首先鏈cDNA合成反應(yīng)中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應(yīng)時設(shè)計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關(guān)系,一般建議每5μg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5μg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導(dǎo)致小片段產(chǎn)物(<500bp)的增加和長片斷、全長產(chǎn)物產(chǎn)物的降低。酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個重要表示,逆轉(zhuǎn)錄在研究RNA表達(dá)調(diào)控等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用前景。逆轉(zhuǎn)錄實驗后的DNA的片段可用于測序等高通量技術(shù)。廣州快速逆轉(zhuǎn)錄報價
逆轉(zhuǎn)錄的過程:生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過程就比較復(fù)雜,比如逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風(fēng)”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu),充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當(dāng)作引物使用。被用作引物的tRNA會結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復(fù)序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復(fù)制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(fù)(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結(jié)構(gòu)。加尾法逆轉(zhuǎn)錄混合價格逆轉(zhuǎn)錄實驗中可以通過qPCR檢測逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)效果。
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細(xì)胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細(xì)胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。
逆轉(zhuǎn)錄引物:加尾法逆轉(zhuǎn)錄引物的結(jié)構(gòu)并不是想象中那么簡單的oligodT,其包含三個關(guān)鍵結(jié)構(gòu):①為了與PolyA序列互補配對,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR過程中反向引物與cDNA的結(jié)合。③OligodT序列的3端存在一個或兩個錨定堿基,V或者VN。(兼并堿基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一種)。如果沒有錨定堿基,逆轉(zhuǎn)錄引物中的OligodT就會隨機結(jié)合到PolyA的任意位置,這樣會造成同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度不一,給較后的熔解曲線檢測帶來麻煩。因此,錨定堿基的作用就是特異性地結(jié)合到miRNA上,從而讓逆轉(zhuǎn)錄引物結(jié)合到緊挨著miRNA的那段PolyA序列上。只有這樣,才能夠保證同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物大小相同。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以進行從RNA到DNA的轉(zhuǎn)化,從而保護RNA序列的完整性。
逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:對于線性基因組,其滯后鏈的末端是無法完整復(fù)制的,每次約損失30-200個核苷酸(Cells.2020Feb22;9(2).)。這樣隨著細(xì)胞分裂,端粒會持續(xù)縮短,造成復(fù)制性衰老。對于大多數(shù)體細(xì)胞來說,端粒磨損是一種控制其分裂潛力的機制,但對于需要多次增殖的干細(xì)胞來說,必須設(shè)法維持端粒長度。端粒酶(telomerase)可以通過逆轉(zhuǎn)錄過程延長端粒。端粒酶由端粒酶RNA(TERC)和端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT)組成。TERT使用TERC作為模板,在染色體的單鏈末端合成端粒DNA的重復(fù)序列。大多數(shù)體細(xì)胞缺乏端粒酶活性,因而容易衰老。但未分化的生殖細(xì)胞,干細(xì)胞,活化的淋巴細(xì)胞和大多數(shù)疙瘩細(xì)胞具有高水平的端粒酶活性,可以克服端粒磨損并維持無限的細(xì)胞分裂。逆轉(zhuǎn)錄實驗盡量避免多次凍融處理RNA樣品,避免樣品質(zhì)量下降。廣州miQP2逆轉(zhuǎn)錄報價
逆轉(zhuǎn)錄過程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒。廣州快速逆轉(zhuǎn)錄報價
miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄:miRNA,即microRNA,是一類非常短的RNA分子,只有幾十到幾百個核首酸,在正常細(xì)胞存活期間會產(chǎn)生大量的miRNA。miRNA起著重要的抑制作用,它可以抑制特定mRNA的表達(dá)以及細(xì)胞中內(nèi)含物翻譯和轉(zhuǎn)錄等功能他們是催化機制,負(fù)責(zé)影響細(xì)胞及其產(chǎn)物的生物學(xué)復(fù)雜性和穩(wěn)定性,對于宿主機體影響是非常重要的。miRNA加尾法是一種獲得miRNA及其前體的研究方法之。較重要的是,它是RNA千擾技術(shù)的一個重要組成部分。過去的研究發(fā)現(xiàn),通過miRNA加尾法獲得的新miRNA表達(dá)調(diào)節(jié)了細(xì)胞信號傳導(dǎo)、細(xì)胞分裂和細(xì)胞凋亡等多重信號傳遞通路,其過程非常復(fù)雜。廣州快速逆轉(zhuǎn)錄報價
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