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確保Cre重組酶只作用于特定細(xì)胞,主要通過(guò)以下幾種方式實(shí)現(xiàn):1.**組織特異性啟動(dòng)子**:-利用組織特異性啟動(dòng)子控制Cre重組酶的表達(dá),可以確保Cre酶只在特定組織或細(xì)胞中表達(dá)。這種方法通過(guò)將Cre基因置于特定細(xì)胞類型特有的啟動(dòng)子控制之下,實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre酶表達(dá)的精確控制。2.**誘導(dǎo)型Cre重組酶系統(tǒng)**:-通過(guò)使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre活性的時(shí)間控制。在無(wú)他莫昔芬誘導(dǎo)時(shí),Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合,定位于細(xì)胞質(zhì)中;當(dāng)他莫昔芬給藥誘導(dǎo)時(shí),Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進(jìn)入細(xì)胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當(dāng)于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個(gè)由他莫昔芬控制的外源開(kāi)關(guān),使得體內(nèi)基因編輯更具時(shí)空靈活性。3.**藥物誘導(dǎo)的Cre系統(tǒng)**:-例如Tet-on系統(tǒng),通過(guò)四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來(lái)激起基因表達(dá)。在三重轉(zhuǎn)基因動(dòng)物中,rtTA在特定啟動(dòng)子的控制下表達(dá),多西環(huán)素與rtTA結(jié)合,Cre的表達(dá),導(dǎo)致固定的報(bào)告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動(dòng)子的腺相關(guān)病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細(xì)胞。
在cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)中,Ultra-Long Master Mix 可以用來(lái)擴(kuò)增5'和3'末端的長(zhǎng)片段cDNA。Recombinant Rat PDGF-BB
T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢(shì):1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過(guò)使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對(duì)顯示出高的突變頻率和刪除長(zhǎng)度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動(dòng)物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(hào)(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時(shí)。Recombinant Human SIRP Beta 1 isoform 3 Protein,His-Avi Tag通過(guò)工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴(kuò)大FnCas12a可以靶向的范圍 。
T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在突變體檢測(cè)和基因編輯效率評(píng)估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應(yīng)用步驟和特點(diǎn):1.**基因編輯效率評(píng)估**:-T7EI用于評(píng)估CRISPR-Cas9在給定的導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)上對(duì)細(xì)胞群體進(jìn)行基因編輯的效率。-通過(guò)PCR擴(kuò)增圍繞CRISPR導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導(dǎo)的非同源末端連接(NHEJ)修復(fù)事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴(kuò)增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測(cè)**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識(shí)別該DNA上的不完全配對(duì)的DNA位點(diǎn)然后進(jìn)行雙鏈切割,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識(shí)別長(zhǎng)度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯(cuò)配DNA,不能識(shí)別1bp的插入、缺失或突變。3.**實(shí)驗(yàn)步驟**:-收集細(xì)胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴(kuò)增期望編輯的基因組區(qū)域。擴(kuò)增子的長(zhǎng)度建議為0.5-1kb。-對(duì)擴(kuò)增的DNA進(jìn)行變性和退火復(fù)性,以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物,在37℃孵育15分鐘。
在質(zhì)粒DNA提取過(guò)程中,確保DNA的完整性和活性至關(guān)重要,這通常涉及以下幾個(gè)關(guān)鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當(dāng)?shù)牧呀夥椒▽?duì)于保持DNA的完整性至關(guān)重要。對(duì)于大于15kb的質(zhì)粒DNA,應(yīng)采用溫和的裂解方法,如將細(xì)菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,以減少對(duì)質(zhì)粒DNA的機(jī)械剪切力,從而保護(hù)其完整性。2.**避免過(guò)度裂解**:在質(zhì)粒提取過(guò)程中,并非裂解時(shí)間越長(zhǎng)越好。過(guò)長(zhǎng)的裂解時(shí)間可能會(huì)造成基因組DNA片段的污染,影響質(zhì)粒的純度。3.**適當(dāng)?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過(guò)程中,適當(dāng)?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì),但過(guò)度洗滌可能會(huì)導(dǎo)致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤(rùn)柱膜,以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過(guò)小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過(guò)程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時(shí),避免長(zhǎng)時(shí)間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護(hù)DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進(jìn)行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護(hù)DNA的完整性。
qPCR(定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性可能受到多種因素的影響,以下是一些關(guān)鍵因素:1.**引物和探針設(shè)計(jì)**:引物和探針的設(shè)計(jì)質(zhì)量對(duì)qPCR的成功至關(guān)重要。不合適的引物設(shè)計(jì)可能導(dǎo)致低特異性或效率低的PCR反應(yīng)。引物的選擇應(yīng)考慮引物的長(zhǎng)度、Tm值(解離溫度)和GC含量,以確保其適用于特定的核酸模板。2.**模板質(zhì)量和純度**:模板的質(zhì)量和純度直接影響qPCR的結(jié)果。污染或降解的模板可能導(dǎo)致偏差或虛假陽(yáng)性結(jié)果。使用質(zhì)量高、純度高的DNA或RNA樣本是確保準(zhǔn)確和可靠的qPCR結(jié)果的關(guān)鍵。3.**反應(yīng)條件和緩沖液**:PCR反應(yīng)條件,包括溫度、離子濃度和緩沖液成分,必須嚴(yán)格控制。溫度梯度、離子濃度的變化或緩沖液成分的誤配可能會(huì)影響PCR效率。4.**反應(yīng)容器和耗材**:反應(yīng)管、微孔板、封閉膜等反應(yīng)容器和耗材的質(zhì)量也會(huì)影響qPCR結(jié)果。低質(zhì)量的材料可能導(dǎo)致樣本丟失或反應(yīng)失效。5.**標(biāo)準(zhǔn)曲線和校準(zhǔn)**:標(biāo)準(zhǔn)曲線的準(zhǔn)備和校準(zhǔn)非常重要。不正確的標(biāo)準(zhǔn)曲線可能導(dǎo)致定量結(jié)果的不準(zhǔn)確性。確保標(biāo)準(zhǔn)曲線中包含適當(dāng)?shù)膶?duì)照樣品,并使用線性擬合來(lái)生成準(zhǔn)確的定量數(shù)據(jù)。6.**環(huán)境條件**:實(shí)驗(yàn)室溫度、濕度和空氣質(zhì)量都可以影響qPCR實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。不穩(wěn)定的環(huán)境條件可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不穩(wěn)定性。隨后,泛素分子從E1轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2,再通過(guò)泛素連接酶E3的作用,將泛素分子連接到靶蛋白上。Recombinant Biotinylated Human FGL1 Protein,His-Avi Tag
激發(fā)的泛素被轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2的活性位點(diǎn)半胱氨酸殘基上,形成E2-泛素硫酯中間體。Recombinant Rat PDGF-BB
磁珠法PCR/DNA純化試劑盒在科研中的應(yīng)用非常廣,主要包括以下幾個(gè)方面:1.**PCR產(chǎn)物的純化**:磁珠法試劑盒可以從PCR反應(yīng)液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、鹽類等雜質(zhì),回收率高,產(chǎn)物純度好,可以直接應(yīng)用于PCR、連接、測(cè)序、NGS建庫(kù)等下游實(shí)驗(yàn)。2.**基因組DNA的提取**:適用于從血液、唾液、口腔拭子和動(dòng)物組織等樣品中分離純化高質(zhì)量基因組DNA,提取的DNA片段大,純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠,適合高通量工作站的自動(dòng)化提取。3.**質(zhì)粒DNA的提取**:磁珠用于從粗制的提取物中分離質(zhì)粒DNA,通過(guò)精心優(yōu)化的溶液將質(zhì)粒DNA從基因組DNA和蛋白質(zhì)中分離出來(lái)。4.**DNA片段的分離**:有許多類型的DNA分離試劑盒可供選擇,包括DNA片段的分離。DNA片段可能需要為下一代測(cè)序協(xié)議進(jìn)行分離,在這種情況下,可以用能選擇分子大小的磁珠來(lái)分離片段。5.**自動(dòng)化和高通量操作**:磁珠法試劑盒適合手工操作,也可用于自動(dòng)化工作站或核酸自動(dòng)提取儀,實(shí)現(xiàn)高通量操作。6.**分子生物學(xué)研究**:磁珠法試劑盒在基因組研究、分子進(jìn)化研究等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用,為遺傳病研究、篩查等提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。Recombinant Rat PDGF-BB