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酵母重組表達(dá)的N-糖苷酶F(PNGaseF)是一種酰胺水解酶,具有以下特點(diǎn):1.**高效性**:PNGaseF是去除幾乎所有N-連接寡糖從糖蛋白中有效的酶法方法。它能夠在幾分鐘內(nèi)快速且無偏倚地釋放所有的N-糖鏈,適合后續(xù)的色譜或質(zhì)譜分析。2.**重組酶**:該酶是重組的酰胺酶,能夠從高甘露糖、雜合和復(fù)雜寡糖中切割內(nèi)GlcNAc和天冬氨酸殘基之間的連接。3.**純度**:純度達(dá)到95%以上,通過SDS-PAGE和完整ESI-MS進(jìn)行確定。4.**儲(chǔ)存穩(wěn)定性**:在含有50%甘油的儲(chǔ)存緩沖液中,好的活性和穩(wěn)定性可維持長達(dá)24個(gè)月。5.**使用條件**:可以在原生或變性條件下使用,對(duì)于變性條件下的去糖基化,建議添加NP-40以解除SDS的抑制作用。6.**比活性**:具有高達(dá)100000U/mL的比活性。7.**His標(biāo)簽**:產(chǎn)品帶有His標(biāo)簽,常用于抗體及其相關(guān)蛋白的完全去糖基化。8.儲(chǔ)存條件:-25~-15℃保存,有效期1年。9.**無甘油版本**:還提供了無甘油版本的PNGaseF,這有助于在HPLC和質(zhì)譜分析中獲得結(jié)果。10.**酶活定義**:1個(gè)酶活力單位指在10μL的反應(yīng)體系中,37℃條件下1小時(shí)從10μg變性RNaseB中除去超過95%的碳水化合物所需要的酶量。這些特點(diǎn)使得酵母重組表達(dá)的PNGaseF成為研究和分析糖蛋白糖鏈結(jié)構(gòu)的重要工具。Pfu DNA Polymerase 具有較高的保真度,能夠在DNA合成過程中減少錯(cuò)誤摻入的堿基,降低非目標(biāo)突變的發(fā)生率。Recombinant Canine GDF15 Protein,His Tag
NLS-Cas9-EGFPNuclease是一種融合蛋白,由Cas9核酸酶、核定位信號(hào)(NLS)和EGFP(綠色熒光蛋白)組成。這種融合蛋白的特點(diǎn)和科研應(yīng)用如下:**特點(diǎn):**1.**無DNA污染**:系統(tǒng)不添加外部DNA,降低了外源DNA污染的風(fēng)險(xiǎn)。2.**高切割效率**:NLS確保Cas9蛋白能夠高效地進(jìn)入細(xì)胞核,從而提高DNA切割效率。3.**低脫靶效應(yīng)**:由于Cas9核酸酶的瞬時(shí)表達(dá),減少了在非目標(biāo)位點(diǎn)切割的可能性。4.**節(jié)省時(shí)間**:與需要轉(zhuǎn)錄和翻譯的mRNA或質(zhì)粒系統(tǒng)相比,NLS-Cas9-EGFPNuclease可以直接進(jìn)入細(xì)胞核,無需等待轉(zhuǎn)錄和翻譯過程。5.**EGFP標(biāo)簽**:EGFP作為報(bào)告基因,可用于追蹤或分選轉(zhuǎn)染細(xì)胞,便于通過熒光激起細(xì)胞分選(FACS)富集所需基因組編輯的細(xì)胞群,減少單細(xì)胞克隆和基因分型的勞動(dòng)和成本。**科研應(yīng)用:**1.**體外DNA切割篩選**:可以用于篩選高效和特異性靶向的gRNA,通過體外DNA切割實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證gRNA的效率和特異性。2.**體內(nèi)基因編輯**:與特定的gRNA結(jié)合后,可以通過電穿孔或注射的方式進(jìn)行體內(nèi)基因編輯。3.**細(xì)胞追蹤和分選**:利用EGFP熒光標(biāo)記,可以追蹤轉(zhuǎn)染細(xì)胞并進(jìn)行分選,這對(duì)于研究基因編輯后的細(xì)胞群體特別有用。
IdeSProtease的分子改造技術(shù)主要通過以下幾個(gè)方面提高其穩(wěn)定性和比活性:1.**定向進(jìn)化**:利用定向進(jìn)化方法,通過多輪的突變和篩選,獲得具有改善特性的酶變體。定向進(jìn)化不依賴于大規(guī)模突變文庫的構(gòu)建,而是通過定點(diǎn)突變操作,顯著提高酶分子的穩(wěn)定性。2.**半理性設(shè)計(jì)與理性設(shè)計(jì)**:結(jié)合半理性設(shè)計(jì)和理性設(shè)計(jì)的方法,通過計(jì)算模擬和結(jié)構(gòu)分析,對(duì)酶的三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,以提高其在各種環(huán)境條件下的穩(wěn)定性。3.**糖基化修飾**:作為一種新的酶分子穩(wěn)定性改造技術(shù),糖基化可以提高酶的穩(wěn)定性,防止酶在逆境中的失活,從而提高其在實(shí)際應(yīng)用中的催化活性。4.**消除蛋白質(zhì)中的不穩(wěn)定性弱點(diǎn)**:通過分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中的穩(wěn)定性弱點(diǎn),進(jìn)行定點(diǎn)突變,以增強(qiáng)蛋白質(zhì)的整體穩(wěn)定性。5.**提高比活性**:通過分子改造,提高IdeSProtease的比活性,使其在更低的濃度下就能有效地催化反應(yīng),從而提高整體的催化效率。6.**增加底物特異性**:改造后的IdeSProtease除了可以切割人IgG1~4、猴、羊、兔IgG外,還對(duì)小鼠IgG2a、IgG3具有特異性切割活性。。
檢測重組EGFP(增強(qiáng)型綠色熒光蛋白)的活性和穩(wěn)定性通常涉及一系列生物化學(xué)和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法。以下是一些常用的檢測方法:1.**SDS-PAGE電泳**:-通過SDS-PAGE電泳分析EGFP的純度和分子量。-觀察是否有蛋白質(zhì)降解或聚合的跡象。2.**WesternBlot**:-使用特異性的GFP抗體進(jìn)行Westernblot,以檢測EGFP蛋白的存在和大小。-可以評(píng)估EGFP的表達(dá)水平和純度。3.**熒光光譜分析**:-使用熒光光譜儀測量EGFP的激發(fā)和發(fā)射光譜。-評(píng)估熒光強(qiáng)度和比較大激發(fā)/發(fā)射波長,以確定其熒光特性。4.**流式細(xì)胞儀分析**:-如果EGFP融合蛋白表達(dá)在細(xì)胞中,可以使用流式細(xì)胞儀分析細(xì)胞群體的熒光強(qiáng)度。-這有助于評(píng)估EGFP的表達(dá)水平和細(xì)胞內(nèi)分布。5.**熒光顯微鏡觀察**:-在熒光顯微鏡下觀察EGFP的亞細(xì)胞定位和表達(dá)模式。-通過時(shí)間序列成像,可以評(píng)估EGFP在活細(xì)胞中的動(dòng)態(tài)變化和穩(wěn)定性。6.**熱穩(wěn)定性分析**:-通過逐漸升高溫度并測量熒光強(qiáng)度的變化,可以評(píng)估EGFP的熱穩(wěn)定性。-熱穩(wěn)定性差的EGFP可能會(huì)在高溫下迅速失去活性。7.**光穩(wěn)定性測試(光漂白實(shí)驗(yàn))**:-通過持續(xù)光照并監(jiān)測熒光強(qiáng)度的下降(光漂白),可以評(píng)估EGFP的光穩(wěn)定性。由于Cas9 NLS系統(tǒng)不涉及DNA的整合,因此降低了外源DNA整合至細(xì)胞基因組的風(fēng)險(xiǎn) 。
高保真Cas9變體在實(shí)際應(yīng)用中的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**降低脫靶效應(yīng)**:高保真Cas9變體通過減少與非目標(biāo)DNA序列的結(jié)合,從而降低了基因編輯過程中的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。這對(duì)于減少基因編輯可能帶來的非預(yù)期效果至關(guān)重要。2.**提高特異性**:通過工程化改造,如SpCas9-HF1、eSpCas9和HypaCas9等變體,通過在DNA相互作用位點(diǎn)引入突變,減少了對(duì)目標(biāo)DNA的非特異性識(shí)別和切割。3.**擴(kuò)展PAM序列兼容性**:一些高保真Cas9變體,如xCas93.7,能夠識(shí)別多種PAM序列,從而擴(kuò)展了可編輯基因組區(qū)域的范圍。4.**提高效果**:在臨床中,高保真Cas9變體可以減少由于脫靶效應(yīng)引起的潛在風(fēng)險(xiǎn),提高基因的安全性和有效性。然而,高保真Cas9變體也存在一些局限性:1.**編輯效率可能降低**:在提高特異性的同時(shí),可能會(huì)有一定的編輯效率。一些高保真變體可能在保持特異性的同時(shí),編輯效率有所下降。2.**結(jié)構(gòu)和功能復(fù)雜性**:高保真Cas9變體的結(jié)構(gòu)改造可能增加其結(jié)構(gòu)和功能的復(fù)雜性,這可能對(duì)實(shí)際應(yīng)用中的穩(wěn)定性和可預(yù)測性帶來挑戰(zhàn)。3.**成本和可用性**:開發(fā)和生產(chǎn)高保真Cas9變體可能需要更多的研究和資源投入,這可能影響其在某些應(yīng)用中的成本效益。可以利用現(xiàn)有的計(jì)算工具,如CRISPR design tools,預(yù)測gRNA的活性和特異性,以輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 。Recombinant Human TNFSF12 Protein,hFc Tag
FnCas12a特異性識(shí)別并剪切帶PAM序列的雙鏈DNA(dsDNA)靶標(biāo),其PAM序列為5'-TTN-3',與Cas9的PAM序列不同。Recombinant Canine GDF15 Protein,His Tag
EndoS酶在抗體藥物偶聯(lián)物(ADCs)研究中的具體應(yīng)用主要體現(xiàn)在糖鏈定點(diǎn)偶聯(lián)技術(shù)方面。根據(jù)上海藥物研究所的研究進(jìn)展,EndoS酶被用于實(shí)現(xiàn)定點(diǎn)ADC化合物的“一步”制備,這是一種新穎的糖鏈定點(diǎn)ADC制備策略。該策略利用了新穎截短型糖結(jié)構(gòu)的藥物-連接子和野生型糖苷內(nèi)切酶EndoS2,將小分子細(xì)胞毒藥物直接定點(diǎn)連接到抗體糖基化位點(diǎn),從而克服了傳統(tǒng)糖鏈定點(diǎn)ADC制備策略的限制。具體來說,研究人員通過篩選發(fā)現(xiàn),EndoS2酶可以將二糖底物L(fēng)acNAc轉(zhuǎn)移至去糖抗體N297位糖基化位點(diǎn),并且LacNAc半乳糖6號(hào)位唾液酸化修飾不影響EndoS2的轉(zhuǎn)糖基化活性。這一發(fā)現(xiàn)使得EndoS2和LacNAc的組合可以直接實(shí)現(xiàn)野生型抗體的糖基化改造,且EndoS2對(duì)多樣化LacNAc修飾的兼容性,可以高效獲得多樣性功能修飾的巖藻糖化或去巖藻糖化的糖工程抗體。此外,研究人員還利用疊氮化修飾的LacNAc底物實(shí)現(xiàn)了抗體糖基化位點(diǎn)的“一步”疊氮化修飾,并通過點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)偶聯(lián)藥物-連接子,實(shí)現(xiàn)了“兩步”制備得到定點(diǎn)ADC化合物。