5'DNA腺苷酰化試劑盒中使用的酶通常被稱為腺苷?;?Adenylase),這種酶能夠催化5'端磷酸化的單鏈DNA或RNA(pDNA或pRNA)轉(zhuǎn)換成5'端腺苷?;疍NA或RNA(AppDNA或AppRNA)。根據(jù)搜索結(jié)果,該酶的來源是嗜熱古細(xì)菌,在大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá)并純化而獲得。這種酶在反應(yīng)中將ATP分解成AMP和PPi,然后將AMP轉(zhuǎn)移到單鏈DNA的5'磷酸基團上,形成腺苷?;瘑捂淒NA,從而制備出腺苷?;宇^(linker)。此外,一些5'DNA腺苷酰化試劑盒中使用的酶是MthRNA連接酶(例如NEB#M2611A),這種酶也用于生成高產(chǎn)量的5'腺苷?;疍NA,并且操作簡便,具有超過95%的效率,無需凝膠純化即可完成單步反應(yīng)。MthRNA連接酶是一種已知能夠在65℃下有效工作的酶,有助于避免DNA的二級結(jié)構(gòu)對腺苷?;磻?yīng)的干擾。這些酶的高效率和特異性使得5'DNA腺苷?;噭┖性趩捂淒NA的5'端腺苷?;揎椫蟹浅S行?,常用于miRNA等3'端為羥基的RNA或單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等應(yīng)用中。在目標(biāo)蛋白的C末端添加His標(biāo)簽和Avi標(biāo)簽。有助于通過親和層析進(jìn)行蛋白純化,而Avi標(biāo)簽則可以用于生物素。Recombinant Human LIGHT/TNFSF14(His Tag)
轉(zhuǎn)座酶是一類能夠催化轉(zhuǎn)座子(一種可移動的DNA序列)在基因組中從一個位置移動到另一個位置的酶。轉(zhuǎn)座子可以在DNA分子上“跳躍”,在新的位置上插入自己的拷貝,而原始位置的轉(zhuǎn)座子則可能被切除或保留。轉(zhuǎn)座酶的作用是轉(zhuǎn)座過程中的關(guān)鍵因素,它們可以被分為兩類:1.**復(fù)制型轉(zhuǎn)座酶**:在復(fù)制型轉(zhuǎn)座過程中,轉(zhuǎn)座子首先被復(fù)制,然后復(fù)制的拷貝到新的基因組位置,原始的轉(zhuǎn)座子留在原位。這種機制通常涉及到“復(fù)制-粘貼”的過程。2.**剪切型轉(zhuǎn)座酶**:在剪切型轉(zhuǎn)座過程中,轉(zhuǎn)座子從原始位置被切除,然后到新的基因組位置。這涉及到“剪切-粘貼”的過程。轉(zhuǎn)座酶的活性和轉(zhuǎn)座子的移動可以對基因組的結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)生重要影響,包括:-**基因突變**:轉(zhuǎn)座子的插入可能破壞基因的正常功能,導(dǎo)致突變。-**基因組多樣性**:轉(zhuǎn)座活動增加了基因組的多樣性,有助于物種適應(yīng)環(huán)境變化。-**基因調(diào)控**:轉(zhuǎn)座子的插入可能激起或抑制某些基因的表達(dá)。-**新基因產(chǎn)生**:在某些情況下,轉(zhuǎn)座子的移動可以導(dǎo)致新基因的產(chǎn)生。
重組酶聚合酶擴增技術(shù)(RecombinasePolymeraseAmplification,簡稱RPA)是一種核酸擴增技術(shù),能夠在等溫條件下快速檢測特定DNA序列。這項技術(shù)以其快速、靈敏度高、特異性強、對設(shè)備要求低等優(yōu)點,在臨床快速診斷、食品檢測、防控、工業(yè)應(yīng)用、現(xiàn)場實時檢測等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用潛力。**技術(shù)原理**:RPA技術(shù)主要依賴于幾種關(guān)鍵的酶和蛋白質(zhì):-**重組酶**:能夠識別并結(jié)合到單鏈核酸(寡核苷酸引物)上。-**單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)**:與被置換的單鏈DNA結(jié)合,防止其重新結(jié)合形成雙鏈。-**鏈置換DNA聚合酶**:在引物定位同源序列后,進(jìn)行鏈延伸,實現(xiàn)DNA的指數(shù)增長。RPA的工作原理是,重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動DNA合成,對模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴增。整個過程進(jìn)行得非常快,一般可在十分鐘之內(nèi)獲得可檢出水平的擴增產(chǎn)物。**技術(shù)優(yōu)勢**:-**快速性**:RPA可以在37-42°C的等溫條件下快速完成核酸的擴增,通常在10到30分鐘內(nèi)即可完成。-**靈敏度和特異性**:RPA能夠檢測低至單拷貝的核酸模板,并具有高特異性。
重組酶是一類能夠促進(jìn)DNA分子之間同源或非同源序列的重組的酶。它們在分子生物學(xué)、遺傳工程和細(xì)胞生物學(xué)中扮演著重要角色。重組酶的作用機制通常涉及識別特定的DNA序列,催化DNA鏈的斷裂和重新連接,從而實現(xiàn)遺傳物質(zhì)的重組。重組酶的主要類型和功能包括:1.限制性內(nèi)切酶**(RestrictionEnzymes):這些酶可以識別特定的DNA序列并在這些序列處切割DNA鏈。它們是基因工程中常用的工具,用于DNA片段的精確切割和克隆。2.連接酶(Ligases):連接酶可以將兩個DNA片段連接在一起,形成穩(wěn)定的DNA分子。在DNA克隆和修復(fù)過程中,連接酶用于封閉切割位點產(chǎn)生的缺口。3.整合酶(Integrases):整合酶能夠?qū)⒁欢蜠NA序列插入到宿主基因組的特定位置。它們在基因和遺傳工程中具有應(yīng)用。4.轉(zhuǎn)座酶(Transposase):轉(zhuǎn)座酶可以催化DNA片段從一個位置移動到另一個位置,這種機制在基因組中存在,并且在遺傳多樣性和進(jìn)化中起著作用。5.**重組酶**(Recombinases):如RecA蛋白和Rad51蛋白,它們在同源重組中發(fā)揮作用,促進(jìn)DNA雙鏈斷裂的修復(fù)和遺傳物質(zhì)的重組。6.DNA聚合酶:這類酶在DNA復(fù)制和修復(fù)中添加新的核苷酸,以現(xiàn)有DNA鏈為模板合成新的DNA鏈。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶組成,具有以下主要應(yīng)用:1.**高通量測序建庫**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶可以用于快速構(gòu)建用于高通量測序的DNA文庫,通過其轉(zhuǎn)座酶活性實現(xiàn)DNA片段化,同時加上測序接頭,簡化了傳統(tǒng)DNA測序建庫的多步過程。2.**CUT&Tag技術(shù)**:這是一種新興的蛋白質(zhì)與DNA相互作用研究方法,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶利用ProteinA與特定抗體結(jié)合,將轉(zhuǎn)座酶帶到目標(biāo)蛋白附近進(jìn)行DNA切割和標(biāo)簽添加,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)結(jié)合位點的高通量測序分析。CUT&Tag技術(shù)具有高特異性、低背景噪音、高靈敏度、良好重復(fù)性等優(yōu)點,適用于表觀遺傳學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶也可用于ATAC-seq實驗,這是一種研究染色質(zhì)可及性的方法,通過轉(zhuǎn)座酶在沒有核酸酶消化的情況下切割染色質(zhì)DNA,然后在切割位點加上測序接頭,進(jìn)行后續(xù)的測序分析。4.**轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫**:有研究開發(fā)了基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5轉(zhuǎn)座酶直接作用于RNA/DNA雜交鏈,簡化了建庫過程,適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,提高了樣本的利用率和測序速度。
蛋白在表達(dá)過程中形成包涵體,需要通過復(fù)性步驟恢復(fù)其活性。這通常涉及物質(zhì)的存在下進(jìn)行蛋白質(zhì)的重折疊。Recombinant Human LIGHT/TNFSF14(His Tag)
PCR抑制劑是指那些在PCR反應(yīng)中能夠干擾或阻礙DNA擴增的物質(zhì)。這些物質(zhì)通常來源于生物樣本本身或者樣本的收集和處理過程。以下是一些PCR抑制劑的特點:1.**多樣性**:PCR抑制劑可以是多種不同的化合物,包括膽酸鹽、尿素、血紅素、酚類化合物、蛋白質(zhì)、多糖、植物或血液成分等。2.**來源**:它們可能來自血液(如血紅素)、尿液(如尿素)、糞便(如膽酸鹽)、植物(如多酚和多糖)、土壤(如腐殖酸)或化學(xué)物質(zhì)(如酚類化合物)。3.**影響**:抑制劑可以影響DNA聚合酶的活性,干擾引物的退火,或與DNA模板發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致PCR擴增效率降低或特異性下降。4.**復(fù)雜性**:由于樣本來源的復(fù)雜性,不同的抑制劑可能需要不同的策略來克服。某些抑制劑可能通過物理方法(如離心、過濾)去除,而其他抑制劑可能需要化學(xué)處理或使用特定的PCR增強劑。5.**濃度依賴性**:抑制效果通常與抑制劑的濃度有關(guān)。在較低濃度下,某些抑制劑可能不會影響PCR,但隨著濃度增加,抑制效果會變得更加明顯。6.**特異性**:某些抑制劑可能對特定的DNA聚合酶或PCR體系有特定的影響。例如,一些抑制劑可能特別影響高GC含量的模板擴增。Recombinant Human LIGHT/TNFSF14(His Tag)