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pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過(guò)改造的高活性Tn5轉(zhuǎn)座酶,與ProteinA融合,形成一種新型融合酶,應(yīng)用于CUT&Tag技術(shù)中,用于研究蛋白質(zhì)與基因組DNA的相互作用。這種融合酶具備以下特點(diǎn):1.**高活性**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是超高活性的突變形式,體外轉(zhuǎn)座效率比野生型高1000倍。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的N端結(jié)構(gòu)域?yàn)镻roteinA的一部分,可以與免疫球蛋白的Fc區(qū)相互作用,特別是與大多數(shù)哺乳動(dòng)物的IgG結(jié)合。3.**Tn5轉(zhuǎn)座酶活性**:C端結(jié)構(gòu)域?yàn)門(mén)n5轉(zhuǎn)座酶,能夠特異性識(shí)別轉(zhuǎn)座子兩端反向重復(fù)的ME序列(MosaicEnd),并在形成轉(zhuǎn)座復(fù)合體后隨機(jī)插入靶DNA中。4.**應(yīng)用廣**:適用于CUT&Tag技術(shù)、高通量測(cè)序建庫(kù)、ATAC-seq等,特別適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。5.**操作簡(jiǎn)便**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)步驟,可以在一步反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)DNA片段化和接頭連接,從細(xì)胞到二代測(cè)序文庫(kù)的轉(zhuǎn)化過(guò)程需9小時(shí)。6.**低細(xì)胞投入量**:CUT&Tag技術(shù)允許從低至60個(gè)細(xì)胞的樣本中獲得結(jié)果,甚至可以應(yīng)用于單細(xì)胞水平的研究。7.**高質(zhì)量結(jié)果**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用可以保證DNA片段化,同時(shí)獲得的蛋白純度高、核酸殘留低。利用牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I的連接原理,可以在無(wú)需DNA連接酶的情況下,快速高效地連接DNA片段,實(shí)現(xiàn)克隆。Recombinant Mouse SEMA4B Protein,His Tag
dITP(脫氧肌苷三磷酸)在PCR(聚合酶鏈反應(yīng))擴(kuò)增中的應(yīng)用是特定和有限的。以下是dITP在PCR擴(kuò)增中的一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**PCR擴(kuò)增中的使用**:dITP可以在某些類型的PCR中替代部分dGTP,特別是在使用某些特殊的DNA聚合酶時(shí),例如那些不具有校正(proofreading)功能的酶。2.**替代比例**:在PCR中,dITP通常不能完全替代dGTP,因?yàn)檫@樣做可能會(huì)抑制PCR擴(kuò)增反應(yīng)。通常推薦在PCR反應(yīng)中使用10%的dITP來(lái)代替dGTP。3.**特殊DNA聚合酶**:某些高保真DNA聚合酶,如碧云天生產(chǎn)的Q6U?高保真DNA聚合酶,可以與dITP一起使用,以提高PCR擴(kuò)增的特異性和效率。4.**dNTP/dITP混合物**:在一些PCR應(yīng)用中,會(huì)使用dNTP/dITP混合物,其中包含2.5mM每種dNTP加上0.25mM的dITP,以優(yōu)化擴(kuò)增條件。5.**PCR反應(yīng)條件**:dITP的使用可能需要優(yōu)化PCR反應(yīng)條件,包括退火溫度、Mg2+濃度和循環(huán)次數(shù)。6.**穩(wěn)定性和儲(chǔ)存**:dITP溶液應(yīng)儲(chǔ)存在-20°C或更低的溫度下,以保持其穩(wěn)定性。使用時(shí)應(yīng)避免多次凍融,以防止降解。7.**安全性和專業(yè)性**:dITP和其他PCR組分應(yīng)由專業(yè)人員用于科研目的,不應(yīng)在臨床診斷中使用。Transportan在基因編輯中,Pfu DNA Polymerase 可用于目的基因或編輯工具的克隆,減少克隆過(guò)程中的非目標(biāo)突變。
DNA瓊脂糖凝膠電泳是一種常用的分子生物學(xué)技術(shù),用于分離、鑒定和定量DNA片段。以下是關(guān)于DNA瓊脂糖凝膠電泳的一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**原理**:-利用瓊脂糖凝膠作為介質(zhì),DNA片段在電場(chǎng)作用下根據(jù)其大小和電荷差異進(jìn)行分離。較小的DNA片段遷移速度快,而較大的片段遷移速度慢。2.**瓊脂糖**:-一種由瓊脂糖粉末和緩沖液(如TAE或TBE)混合制成的凝膠。瓊脂糖濃度通常在0.7%到2%之間,濃度越高,分辨率越高,但凝膠孔隙越小,遷移速度越慢。3.**樣品準(zhǔn)備**:-DNA樣品通常需要在加載前進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚?,如純化、稀釋,有時(shí)還需添加樣品緩沖液以保證樣品在電泳過(guò)程中的穩(wěn)定性。4.**加載樣品**:-使用微量移液管將樣品和加載緩沖液(通常含有追蹤染料,如溴酚藍(lán))混合后,小心地加載到凝膠孔中。5.**電泳**:-將凝膠置于電泳槽中,連接電源,施加恒定電壓進(jìn)行電泳。電壓和時(shí)間根據(jù)凝膠濃度和所需分辨率進(jìn)行調(diào)整。6.**染色**:-電泳完成后,為了可視化DNA條帶,通常使用熒光染料如EB(溴化乙錠)或SYBRGreen進(jìn)行染色。染色后的凝膠在紫外光下觀察,DNA條帶會(huì)發(fā)出熒光。7.**分析**:-通過(guò)比較DNA條帶的位置和已知大小的DNA標(biāo)準(zhǔn)品(DNAladder),可以估計(jì)DNA片段的大小。
重組酶是一類能夠促進(jìn)DNA分子之間同源或非同源序列的重組的酶。它們?cè)诜肿由飳W(xué)、遺傳工程和細(xì)胞生物學(xué)中扮演著重要角色。重組酶的作用機(jī)制通常涉及識(shí)別特定的DNA序列,催化DNA鏈的斷裂和重新連接,從而實(shí)現(xiàn)遺傳物質(zhì)的重組。重組酶的主要類型和功能包括:1.限制性內(nèi)切酶**(RestrictionEnzymes):這些酶可以識(shí)別特定的DNA序列并在這些序列處切割DNA鏈。它們是基因工程中常用的工具,用于DNA片段的精確切割和克隆。2.連接酶(Ligases):連接酶可以將兩個(gè)DNA片段連接在一起,形成穩(wěn)定的DNA分子。在DNA克隆和修復(fù)過(guò)程中,連接酶用于封閉切割位點(diǎn)產(chǎn)生的缺口。3.整合酶(Integrases):整合酶能夠?qū)⒁欢蜠NA序列插入到宿主基因組的特定位置。它們?cè)诨蚝瓦z傳工程中具有應(yīng)用。4.轉(zhuǎn)座酶(Transposase):轉(zhuǎn)座酶可以催化DNA片段從一個(gè)位置移動(dòng)到另一個(gè)位置,這種機(jī)制在基因組中存在,并且在遺傳多樣性和進(jìn)化中起著作用。5.**重組酶**(Recombinases):如RecA蛋白和Rad51蛋白,它們?cè)谕粗亟M中發(fā)揮作用,促進(jìn)DNA雙鏈斷裂的修復(fù)和遺傳物質(zhì)的重組。6.DNA聚合酶:這類酶在DNA復(fù)制和修復(fù)中添加新的核苷酸,以現(xiàn)有DNA鏈為模板合成新的DNA鏈。
磁珠法質(zhì)粒小量抽提試劑盒中的磁珠分離通常涉及以下步驟:1.**裂解細(xì)胞**:-首先,使用裂解液(含有SDS等成分)裂解細(xì)菌細(xì)胞,釋放出質(zhì)粒DNA。2.**結(jié)合磁珠**:-將磁珠加入到裂解后的混合物中,磁珠表面通常修飾有能夠特異性結(jié)合核酸的配體,使得質(zhì)粒DNA吸附于磁珠表面。3.**磁分離**:-將含有磁珠和質(zhì)粒DNA的混合物置于磁分離架上。磁分離架產(chǎn)生磁場(chǎng),使得磁珠迅速聚集在管壁或管底。4.**未結(jié)合物質(zhì)**:-在磁珠固定后,小心移除上清液,避免擾動(dòng)磁珠。上清液中含有未吸附的蛋白質(zhì)、RNA和其他細(xì)胞碎片。5.**洗滌磁珠**:-向磁珠中加入洗滌液,輕輕混勻以去除殘留的雜質(zhì),然后再次使用磁分離架分離磁珠和洗滌液。6.**重復(fù)洗滌**:-根據(jù)試劑盒的說(shuō)明,可能需要進(jìn)行多次洗滌以確保高度純化。每次洗滌后都需洗滌液。7.**干燥磁珠**(如果需要):-在某些情況下,可能需要去除洗滌后的殘留液體,讓磁珠在磁場(chǎng)作用下干燥,但要注意不要使磁珠完全干燥,以免影響DNA的洗脫。8.**洗脫質(zhì)粒DNA**:-使用洗脫液(通常是低鹽或高pH的緩沖液)將質(zhì)粒DNA從磁珠上洗脫。洗脫液可以破壞磁珠與DNA之間的結(jié)合力,釋放DNA。。
在CRISPR-Cas9等基因編輯技術(shù)中,使用Pfu DNA Polymerase進(jìn)行修復(fù)模板的合成。Recombinant Mouse SEMA4B Protein,His Tag
脫氧腺苷三磷酸(Deoxyadenosinetriphosphate,dATP)是一種去氧核苷酸三磷酸,它是DNA合成和復(fù)制過(guò)程中必需的原料之一。dATP的結(jié)構(gòu)與腺苷三磷酸(ATP)相似,但dATP的五碳糖2號(hào)碳上缺少一個(gè)-OH基,取而代之的是一個(gè)氫原子。dATP是四種dNTPs(脫氧核糖核苷酸三磷酸)之一,四種dNTPs包括dATP、dCTP、dGTP和dTTP,它們分別對(duì)應(yīng)DNA中的腺嘌呤、胞嘧啶、鳥(niǎo)嘌呤和胸腺嘧啶。dATP的化學(xué)式為C10H16N5O12P3,分子量為491.182,CAS登錄號(hào)為1927-31-7。在實(shí)驗(yàn)室中,dATP通常以100mM的濃度提供,用于各種分子生物學(xué)技術(shù),如PCR、DNA測(cè)序和分子克隆技術(shù)。dATP溶液需要在低溫條件下保存,通常是-20℃,以保持其穩(wěn)定性和活性。在DNA測(cè)序中,dATP與ddATP一起使用,ddATP是dATP的衍生物,它缺少3'-OH基團(tuán),用于Sanger測(cè)序中的鏈終止反應(yīng)。在PCR中,dATP作為DNA聚合酶的底物,用于合成新的DNA鏈。dNTPs的濃度在PCR反應(yīng)中非常重要,適當(dāng)?shù)臐舛扔兄跍p少錯(cuò)配和提高擴(kuò)增效率。通常,四種dNTPs以等濃度混合使用,以減少PCR過(guò)程中的錯(cuò)配誤差。在某些情況下,根據(jù)目標(biāo)序列的長(zhǎng)度和組成,可能需要調(diào)整dNTPs的濃度,以優(yōu)化PCR反應(yīng)。Recombinant Mouse SEMA4B Protein,His Tag