廣東歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達(dá)解決方案是目前***一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案巧妙的將單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)原理和組織切片染色結(jié)合在一起，從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組 mRNA 的表達(dá)情況，同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類：機(jī)械和光學(xué)。前者包括 Tomo-seq 等，通過沿感興趣軸，利用冷凍切片機(jī)進(jìn)行組織切片，然后在每個(gè)切片上均進(jìn)行 RNA 測(cè)序。10x 提供的載玻片分為兩種：用于摸索組織比較好透化時(shí)間的組織優(yōu)化玻片和用于正式實(shí)驗(yàn)的基因表達(dá)玻片。細(xì)胞通訊是單細(xì)胞研究中一個(gè)模擬與理解復(fù)雜組織生態(tài)系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)的適用方法。廣東歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

廣義上來說，目前一共有4種解析“空間性轉(zhuǎn)錄組”的策略：2.第一種是利用計(jì)算機(jī)算法，根據(jù)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來模擬重構(gòu)組織的空間形態(tài)。例如Seurat，這是一個(gè)在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中***用到的R包，我們可以利用scRNA-seq數(shù)據(jù)，加上對(duì)markegene進(jìn)行原位測(cè)序的結(jié)果來重構(gòu)組織的空間信息。3.第二種，激光顯微切割+二代測(cè)序（LCM+NGS）。這種技術(shù)對(duì)儀器和實(shí)驗(yàn)人員的操作要求較高，而且獲取的通量也比較低，如果組織非常珍貴或者研究的內(nèi)容十分精細(xì)，可以考慮這個(gè)。但是這種策略比較難被官方干運(yùn)用。4.第三種策略，就是基于高分辨圖像的原位測(cè)序。**經(jīng)典的是smFISH當(dāng)然，這種方法的通量比較低。當(dāng)然隨著技術(shù)的發(fā)現(xiàn)，剛發(fā)布的FISH-seq技術(shù)通過多輪雜交的方式，已經(jīng)把測(cè)序通量提高到了10000+個(gè)轉(zhuǎn)錄本。5.***就是“基于空間條形碼（spatialbarcodes）的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)。本文主要討論的也就是這種技術(shù)。后面主要討論的都是基于這種策略。 山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦，而其他***（例如肝臟）的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對(duì)滯后。

基于原位測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)。基于原位測(cè)序（ISS）的方法通過測(cè)序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個(gè)探針與模板匹配，不匹配的探針就會(huì)被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個(gè)探針使用一個(gè)查詢堿基來測(cè)序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個(gè)探針使用兩個(gè)查詢堿基來測(cè)序環(huán)化和RCA擴(kuò)增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測(cè)序，其中還使用了兩個(gè)類似固體的查詢堿基來避免錯(cuò)誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針。基于ISS技術(shù)的優(yōu)勢(shì)包括：?jiǎn)渭?xì)胞分辨率、亞細(xì)胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域。缺點(diǎn)是：檢測(cè)效率較低。

空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí)，多方位測(cè)量轉(zhuǎn)錄組譜。然而，現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國(guó)的科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入，無縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中，輸出同樣存儲(chǔ)在SingleCellExperiment對(duì)象中，該對(duì)象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過質(zhì)量的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破。如何通過“HE染色”判斷空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目樣本是否為“好的樣本”呢？

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的準(zhǔn)確性高嗎？下圖是一個(gè)將10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結(jié)果，從10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果中，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達(dá)，和已知的研究結(jié)果一致性較高。開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組需要做哪些準(zhǔn)備？空間轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)十分前沿的技術(shù)，涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作，例如組織類型的選擇、前期預(yù)實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、病理區(qū)域的確認(rèn)等一系列內(nèi)容。而且實(shí)驗(yàn)中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導(dǎo)致整個(gè)項(xiàng)目失敗。空間轉(zhuǎn)錄組可以進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析，區(qū)別在于空間位置信息可以同時(shí)用于識(shí)別潛在的細(xì)胞間相互作用。青海歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

空間轉(zhuǎn)錄組組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學(xué)信息。廣東歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

中國(guó)銷售產(chǎn)業(yè)憑借獨(dú)特資源和市場(chǎng)優(yōu)勢(shì)，一舉成為資本角逐的重點(diǎn)領(lǐng)域之一。從世界范圍來看，美、歐、日等發(fā)達(dá)地區(qū)的銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展歷史悠久，無論是銷售產(chǎn)品制造業(yè)還是銷售服務(wù)業(yè)，都處于全球優(yōu)先地位。近兩年來，權(quán)健事件、鴻茅藥酒、長(zhǎng)生疫苗等醫(yī)藥領(lǐng)域負(fù)面新聞相繼爆出，醫(yī)美、及制藥成為服務(wù)型問題重災(zāi)區(qū)，這些問題都是對(duì)消費(fèi)者生命財(cái)產(chǎn)安全的漠視，這都極大影響了消費(fèi)者對(duì)服務(wù)型的信任度。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃，醫(yī)用物流公司十分分散，許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高，存儲(chǔ)倉庫與冷藏運(yùn)輸車等的建設(shè)與運(yùn)行成本便居高不下，使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設(shè)到運(yùn)營(yíng)中的成本都遠(yuǎn)超于傳統(tǒng)物流成本。以科研服務(wù)，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢?yōu)槔?，主打運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP停留在工具層面，缺少完整的消費(fèi)場(chǎng)景閉環(huán)，較強(qiáng)的工具屬性停留在實(shí)現(xiàn)用戶**基礎(chǔ)的功能需求，并未涉及足夠高的用戶使用價(jià)值實(shí)現(xiàn)，同時(shí)缺乏數(shù)字化運(yùn)營(yíng)的效能也是運(yùn)動(dòng)健康A(chǔ)PP發(fā)展的明顯桎梏，經(jīng)營(yíng)模式有待進(jìn)一步探索。廣東歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢，是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)，具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項(xiàng)目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，會(huì)務(wù)服務(wù)，企業(yè)管理咨詢。的公司。公司自創(chuàng)立以來，投身于科研服務(wù)，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢，是醫(yī)藥健康的主力軍。歐易生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路，既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng)，又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng)，以敏銳的市場(chǎng)洞察力，實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。