空間轉錄組的應用有哪些?一、構建空間轉錄組圖譜:借助于空間分辨的單細胞轉錄組學,建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術,得到多個***的時空轉錄組圖譜(相關研究后續(xù)會在如下專輯更新)。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍圖:胚胎發(fā)育是一個復雜的過程,其中動態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預期使用空間轉錄組學技術可以表征胚胎發(fā)育的空間表達藍圖??臻g轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態(tài)學信息。重慶歐易生物空間轉錄組報價
許多當前時代空間轉錄組技術的基礎都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。例如,于1976 年首先使用紫外線激光來切割組織。當前流行的技術,例如空間轉錄組學(ST)和 10X Visium 依靠這種微陣列技術,區(qū)別就在于是從放置在微陣列載玻片上的組織上而不是從溶液中來捕獲轉錄本信息。當前時代的空間轉錄組技術大致分為五類方向:激光顯微切割(LCM),單分子熒光原位雜交(smFISH),靶向原位測序(ISS),原位陣列捕獲和 其他非成像技術。廣東空間轉錄組有什么用該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉錄組學數(shù)據(jù)的整合和分析。
空間轉錄組學(ST)是一種方法,允許在組織樣本中可視化和定量分析轉錄組與空間分辨率。通過在載玻片上排列含有位置條形碼的寡核苷酸的組織切片,該方法聲稱可以生成具有精確位置信息的高質量的RNA-seq cDNA文庫。條形碼芯片有1007個帶有獨特條形碼序列的引物位點。每個位置都有一個直徑100μm(對應于一個組織域)中心到中心的距離是200μm。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,在空間轉錄組樣本處理、實驗和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。
空間轉錄組數(shù)據(jù)分析的重要是根據(jù)每個芯片上每個spot的基因表達信息進行聚類,然后將spot根據(jù)坐標位置序列放回到組織的圖像上,同時可以對每個gene在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數(shù)據(jù)后,首先利用Space Ranger 軟件可以自動化的對圖像進行處理、數(shù)據(jù)比對和Barcode處理。另外一個軟件Loupe Cell Browser是一個適用于Windows和MacOS的桌面應用程序,它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium數(shù)據(jù)。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破??臻g轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類:機械和光學。
1. 10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前可選的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息??臻g轉錄組是一項前沿技術,涉及到很多細節(jié)方面的準備工作,例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內(nèi)容。而且實驗中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導致整個項目失敗??臻g轉錄組細胞通訊分析方法簡介及實操。宣傳空間轉錄組價格
Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉錄組解析人鱗狀細胞*的文章。重慶歐易生物空間轉錄組報價
空間轉錄組是在組織原位檢測基因表達的一種技術,與bulk RNA-seq或單細胞轉錄組測序相比,空間轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失,使得我們在檢測基因表達的同時獲得基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。正是由于空間轉錄組可以從多維度解析生物學過程的特點,近年來關于空間轉錄組無論是在技術開發(fā),還是大規(guī)模應用或商業(yè)化,都得到蓬勃發(fā)展。例如2019年4月,Science發(fā)文通過空間轉錄組揭示ALS(肌萎縮側索硬化癥,又稱漸凍癥)分子病理的時空動態(tài);2019年8月,Nature在線發(fā)表了景乃禾團隊解析小鼠早期胚胎細胞的時空表達數(shù)據(jù);2020年9月,Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉錄組解析人鱗狀細胞*的文章;2021年1月,Science發(fā)表了將組織擴展和原位RNA測序結合起來的新型空間轉錄組技術ExSeq;2021年4月,10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空間轉錄組商業(yè)化解決方案。重慶歐易生物空間轉錄組報價
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司位于聯(lián)航路1188號25幢,擁有一支專業(yè)的技術團隊。致力于創(chuàng)造***的產(chǎn)品與服務,以誠信、敬業(yè)、進取為宗旨,以建歐易生物產(chǎn)品為目標,努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè)。公司不僅*提供專業(yè)的檢驗檢測服務。(依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業(yè)管理咨詢。,同時還建立了完善的售后服務體系,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務。誠實、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。