云南篩庫酵母文庫

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-28

酵母單雜交測試:為驗(yàn)證該文庫在Y2H和Y1H體系中的有效性,作者以O(shè)sMADS1為誘餌篩選水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫,進(jìn)行了酵母雙雜交測試。以Ghd7的啟動(dòng)子片段為誘餌,進(jìn)行了酵母單雜交測試。結(jié)果顯示我們的水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫可以有效且高通量的檢測蛋白-水稻TF、DNA-水稻TF間的相互作用。另外,該研究中指出,使用該文庫篩選鑒定蛋白-TF互作,采用mating法較為方便,即Y2HGold-Bait誘餌菌液與Y187-TF文庫菌液一對一雜交。而篩選鑒定DNA-TF互作,采用Y1HGold系統(tǒng),即Y1HGold-pomoter篩選TF文庫質(zhì)粒更簡單高效。此外,可通過降低篩選壓力處理,進(jìn)行弱相互作用的檢測。酵母三雜交酵母文庫數(shù)據(jù)庫。云南篩庫酵母文庫

文章中酵母雙雜交文庫由歐易生物制備。2021年5月,北京林業(yè)大學(xué)鈕世輝副教授為通訊作者,在PlantPhysiology雜志(IF:6.902)在線發(fā)表了題為“MADS-boxtranscriptionfactorsMADS11andDAL1interacttomediatethevegetative-to-reproductivetransitioninpine”的研究論文,深入探討了油松中營養(yǎng)生長-生殖生長時(shí)相轉(zhuǎn)變調(diào)控的分子機(jī)制。北京林業(yè)大學(xué)馬晶晶博士為***作者,文章中酵母雙雜交文庫由歐易生物制備。本研究通過 7 個(gè)樹齡的油松樣品轉(zhuǎn)錄組測序,鑒定到一個(gè)與年齡信號***相關(guān)的基因模塊,該模塊包含 33 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,包括 SOC1-like、DAL1 等。山東篩庫酵母文庫報(bào)價(jià)合作文章上百篇,平均影響因子高達(dá)7.124 歐易生物酵母文庫。

單雜交篩選為了挖掘影響ALA誘導(dǎo)蘋果黃酮醇積累的關(guān)鍵性調(diào)控因子,作者以Y1HGold[proMdFLS1-AbAi] 為誘餌,通過酵母單雜交篩選了ALA處理后的蘋果愈傷組織cDNA文庫。結(jié)果顯示篩選出的蛋白質(zhì)主要參與光合作用調(diào)控、碳糖代謝、氧化/滲透脅迫響應(yīng)、***信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、木質(zhì)素生物合成、果實(shí)成熟發(fā)育等過程,以及一些功能未知的蛋白質(zhì)。其中, MdSCL8轉(zhuǎn)錄因子,由于其在草莓中的同源基因已被報(bào)導(dǎo)與黃酮的合成有關(guān),引起了研究者的注意。進(jìn)一步通過Y1H assay驗(yàn)證確認(rèn)了MdSCL8可以與MdFLS1啟動(dòng)子互作(圖2A)。通過雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)和GUS檢測,發(fā)現(xiàn)MdSCL8可以負(fù)向調(diào)控MdFLS1啟動(dòng)子活性(圖2B-D)。

酵母文庫實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)表明,MdTRB1 可以正向調(diào)節(jié)花青素和原花青素的累積。MdTRB1 與 MdMYB9 結(jié)合可以增強(qiáng)后者對下游基因的轉(zhuǎn)錄***活性。而 MdTRB1 與 MdJAZ1 的結(jié)合,可以干擾其與 MdMYB9 的互作,進(jìn)而負(fù)向調(diào)控 MdTRB1 介導(dǎo)的對花青素和原花青素積累的促進(jìn)作用。本研究表明,JAZ1-TRB1-MYB9 復(fù)合物可以動(dòng)態(tài)調(diào)控 JA 介導(dǎo)的花青素和原花青素的積累。本研究為進(jìn)一步研究 JA 對花青素和原花青素生物合成的調(diào)節(jié)提供了新見解。本研究鑒定了一個(gè)可以與 MdMYB9 相互作用的蛋白 MdTRB1。實(shí)驗(yàn)表明,MdTRB1 可以正向調(diào)節(jié)花青素和原花青素的累積。酵母文庫篩選研究多年建庫與篩選經(jīng)驗(yàn)驗(yàn)證。

酵母文庫:首先我們需要了解什么是"酵母雙雜交技術(shù)"?酵母雙雜交是一種研究真核細(xì)胞體內(nèi)蛋白質(zhì)之間相互作用的有效分子生物學(xué)技術(shù),在功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究中發(fā)揮重要作用。酵母文庫產(chǎn)品線由7個(gè)**實(shí)驗(yàn)室組成,分別有RNA抽提室,RNA質(zhì)檢室、酵母建庫室、大腸桿菌轉(zhuǎn)化室,酵母菌轉(zhuǎn)化室、篩庫室等。使用原裝試劑盒、培養(yǎng)基,保證實(shí)驗(yàn)質(zhì)量。實(shí)驗(yàn)流程細(xì)致謹(jǐn)慎,實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)經(jīng)驗(yàn)豐富。實(shí)驗(yàn)中使用RIN值7以上的RNA,一次建庫服務(wù),多次質(zhì)檢實(shí)驗(yàn),確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)高效準(zhǔn)確。smart酵母建庫和gateway酵母建庫,滿足各類客戶的需求。黑龍江實(shí)力酵母文庫報(bào)價(jià)

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目前,歐易生物負(fù)責(zé)該水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫的維護(hù)和保存工作,并對廣大水稻科研工作者提供轉(zhuǎn)錄因子篩選服務(wù)。如去年歐易生物助力中國科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心的王二濤老師應(yīng)用該文庫對水稻-叢枝菌根進(jìn)行了深入研究,成功構(gòu)建了水稻-叢枝菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),結(jié)果發(fā)表于《Cell》封面。截至文章發(fā)表,該文庫已收錄了1683個(gè)水稻轉(zhuǎn)錄因子,隸屬于54個(gè)家族,覆蓋預(yù)測的水稻轉(zhuǎn)錄因子總量的70%。文庫中水稻轉(zhuǎn)錄因子的a基因信息來源于PlantTFDB和KOME數(shù)據(jù)庫。文庫載體使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子菌株**保存于96孔板中。云南篩庫酵母文庫

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