非靶代謝組學(xué)研究：2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團(tuán)隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果，通過采用非靶代謝組學(xué)和基因表達(dá)芯片，發(fā)現(xiàn)了適應(yīng)酸性微環(huán)境的胰腺導(dǎo)管腺* (PDAC)細(xì)胞具有更強(qiáng)的轉(zhuǎn)移和增殖能力。
代謝組學(xué)顯示適應(yīng)酸性微環(huán)境的 PDAC 細(xì)胞中葡萄糖增加、糖酵解減少，而轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)適應(yīng)酸性微環(huán)境細(xì)胞中的差異表達(dá)基因主要為細(xì)胞外基質(zhì)修飾和 Hippo 信號傳導(dǎo)相關(guān)基因。MMP1 在在適應(yīng)酸性微環(huán)境細(xì)胞中上調(diào)**為明顯，實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了其由 YAP/TAZ 通路介導(dǎo)，而被 AMPK抑制。該研究確認(rèn)了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進(jìn)適應(yīng)酸性微環(huán)境的 PDAC 細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。 讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇。北京代謝組學(xué)測序
GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究：不同分子量聚乙烯顆粒改變了玉米根際土壤微生物群落組成和代謝譜AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究對象：聚乙烯顆粒、玉米、根際土壤發(fā)表期刊：JournalofHazardousMaterials影響因子：10.588組學(xué)技術(shù)：GC-MS非靶向代謝組學(xué)和16SrRNA測序(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)；這項(xiàng)研究的重點(diǎn)是確定不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機(jī)制。本文運(yùn)用非靶向代謝組學(xué)，微生物16SrRNA測序等方法研究的結(jié)果證實(shí)，不同分子量的PE顆粒對土壤-植物系統(tǒng)有不利影響。不同分子量的PE顆粒在形狀和表面微觀結(jié)構(gòu)上存在明顯差異。土壤蔗糖酶和過氧化物酶對不同分子量的PE顆粒有***響應(yīng)。北京代謝組學(xué)測序非靶標(biāo)代謝組學(xué)預(yù)實(shí)驗(yàn)，周期短，報告快，專業(yè)可信耐。
GC-MS代謝組學(xué)和 LC-MS代謝組學(xué)研究：鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學(xué)對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進(jìn)行了研究，利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果表明，在急性低鹽脅迫下，青蟹通過甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化，然后通過ABCs轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白運(yùn)輸氨基酸和碳水化合物，實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)外的滲透平衡。此項(xiàng)研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。王春琳課題組深耕青蟹研究，近些年來探索青蟹對環(huán)境的適應(yīng)變化也在各大期刊上發(fā)表：項(xiàng)目文章|iTRAQ蛋白組學(xué)助力寧波大學(xué)越冬期間擬穴青蟹代謝變化研究項(xiàng)目文章|兩篇背靠背，王春琳、王歡課題組揭示擬穴青蟹適應(yīng)鹽度驟降的代謝機(jī)理
代謝組學(xué)研究：浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風(fēng)險評估研究團(tuán)隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應(yīng)機(jī)制研究中取得新進(jìn)展，作者：楊桂玲，王彥華，李健，王豆，鮑志偉，王強(qiáng)（通訊作者），靳遠(yuǎn)詳（共同通訊作者），在Journal of Hazardous Materials期刊發(fā)表了題為“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果，通過代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)的多組學(xué)整合分析技術(shù)來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復(fù)雜病理生理和毒性通路。代謝組學(xué)——尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系研究方式。
GC-MS非靶向代謝組研究，隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進(jìn)入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學(xué)家的***關(guān)注，本篇為2020年2月，南京大學(xué)趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運(yùn)用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對土壤微生物組和代謝組學(xué)分析技術(shù)的獨(dú)特結(jié)合，提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角，***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。常用的代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。北京代謝組學(xué)測序
代謝組學(xué)專區(qū) 系統(tǒng)生物學(xué)驅(qū)動的功能代謝組學(xué)方法,具有高靈敏、高分辨和高通量。北京代謝組學(xué)測序
代謝組學(xué)等多組學(xué)研究，2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進(jìn)行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。北京代謝組學(xué)測序
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