本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發(fā)現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病??臻g代謝組學 代謝組學測序原理 代謝組學研究價格。浙江lc ms ms 代謝組學
代謝組學數據提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發(fā)現隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D);與正常組對比,***上調的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據發(fā)現隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。浙江醫(yī)學代謝組學 pdf靶向代謝組學、非靶向代謝組學在線咨詢。
GC-MS非靶向代謝組學研究,2022年2月,上海市農業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質組學和代謝組學分析,發(fā)現氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色重要過程,并對其在蛋白質組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。中文標題:氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色形成的重要過程發(fā)表期刊:FrontiersinMicrobiology影響因子:5.64作者單位:上海市農業(yè)科學院食用菌研究所涉及的歐易/鹿明生物服務產品:iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學。
GC-MS代謝組學結果:通過GC-MS代謝組學觀察到 92種化合物,其中,49種與數據庫中可用的化合物相匹配,包括重要的發(fā)酵代謝物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和幾種 (n=10) 初級氨基酸。NMR也觀察到了七種已鑒定的化合物。通過 GC-MS 測量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸濃度隨溫度處理而變化,隨著溫度的升高,通常趨向于更高的糖濃度和更低的游離氨基酸濃度(圖 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一個明顯的例外,在濃度與溫度處理中觀察到了積極的趨勢(圖 3)。此外,與植物應激反應相關的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羥基-3-甲氧基苯甲酸)隨溫度升高而增加(SI 附錄,圖 S5)。非靶標代謝組學預實驗,周期短,報告快,專業(yè)可信耐。
頂空GC-MS代謝組學,中文標題:利用BADH2新等位基因生產芳香三系雜交稻研究對象:水稻發(fā)表期刊:PlantBiotechnologyJournal影響因子:9.803發(fā)表時間:2021.08.31發(fā)表單位:中國水稻研究所運用生物技術:GC-MS頂空代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)、基因編輯技術香味是決定稻米烹飪和食用特性的獨特和關鍵指標之一。2021年8月,中國水稻研究所胡培松院士團隊在PlantBiotechnologyJournal期刊發(fā)表的研究成果,依靠GC-MS頂空代謝組學的平臺對BADH2等位基因系成熟籽粒進行性狀分析。研究新型BADH2等位基因生產芳香雜交水稻機理,加快了水稻品種香味研究改良進程。鹿明生物頂空GC-MS代謝組學測定技術還可用于茶葉、花卉以及各種農產品中酚類、酯類、醇類等揮發(fā)類代謝物使揮發(fā)性物質成分檢測。代謝組學——尋找代謝物與生理病理變化的相對關系研究方式。江蘇代謝組學綜述
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微生物組和代謝組學結果表明,高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調節(jié)消化和粘膜相關的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中,喂養(yǎng)含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結果,因為其共生細菌(如Akkermansia,Lactobacillus和Faecalibacterium)的富集,戊酸鹽的增加以及促炎細胞因子的減少。代謝組學結果顯示盲腸組織的代謝特征發(fā)生了改變,包括脂質肉堿和α-生育酚等代謝物的上調和下調。這些發(fā)現為直鏈淀粉/支鏈淀粉的比例是如何通過調節(jié)微生物發(fā)酵,導致共生微生物群和代謝物的增殖,從而改善斷奶山羊的盲腸環(huán)境提供了新的見解。本篇文章,檢測了喂食不同直鏈淀粉/支鏈淀粉比例的山羊的盲腸中SCFAs和炎癥因子的變化,并使用16s RNA測序檢測了不同組山羊的盲腸粘膜和消化物中微生物的變化,找到了變化的優(yōu)勢菌群以及菌群和SCFAs的相關性。再使用LC-MS/MS非靶代謝組學研究了不同組山羊盲腸組織的代謝物變化。通過多組學結合的方式,揭示了不同比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉對山羊盲腸環(huán)境的影響。浙江lc ms ms 代謝組學
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