TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎?。―KD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標志物。為優(yōu)化糖尿病腎?。―KD）管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標題：血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術支持)、ELISA單細胞蛋白組學之質譜流式細胞技術 。浙江蛋白組學測序一個多少錢
本研究通過生理和蛋白質組學分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料，通過iTRAQ標記蛋白組學和轉錄組學分析，揭示了谷胱甘肽轉移酶活性、碳水化合物結合和谷胱甘肽結合、代謝過程及IAA反應與冷應激反應密切相關，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs，這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質和能量代謝，對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。上海蛋白組學質譜分析結果label free蛋白組學蛋白質組學原理。
DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學研究方法，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標志物。同時作者發(fā)現(xiàn)補體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調，這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用。
iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法：2021年7月，海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法，發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質相關關鍵代謝產物的積累模式特征，探究了不同成熟度油茶轉錄組和蛋白質組譜機理，描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。歐易鹿明生物蛋白質研究技術。
在本研究中，利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發(fā)育過程中，轉錄本和蛋白質組之間存在相當大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關鍵時期：在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值，同時種仁內部大部分營養(yǎng)物質開始迅速積累。通過轉錄組數(shù)據(jù)和蛋白質組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調控網絡，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。修飾蛋白質組試-蛋白質組學 解決方案。上海代謝組學與蛋白組學
蛋白組學研究必看的經典綜述。浙江蛋白組學測序一個多少錢
通過蛋白質組學分析檢測了經M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達的功能基因，包括與炎癥、細胞增殖、免疫調節(jié)和血管生成相關的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標記基因的上調與炎癥因子IL3RA有關，增殖相關蛋白CD40和免疫調節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進人腦微血管內皮細胞的血管生成能力，因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關基因的表達。蛋白質印跡結果顯示血管生成相關基因FlK1和ANGPT1的表達明顯增強(圖2I)。綜上所述，結果證實了M-Exos誘導了人腦微血管內皮細胞的功能改變。浙江蛋白組學測序一個多少錢
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