基于原位測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)?；谠粶y(cè)序（ISS）的方法通過(guò)測(cè)序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個(gè)探針與模板匹配，不匹配的探針就會(huì)被洗掉。2013年開(kāi)發(fā)的ISS中，每個(gè)探針使用一個(gè)查詢堿基來(lái)測(cè)序基因條形碼。FISSEQ和后來(lái)的EXeq使用了SOLiD，每個(gè)探針使用兩個(gè)查詢堿基來(lái)測(cè)序環(huán)化和RCA擴(kuò)增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測(cè)序，其中還使用了兩個(gè)類(lèi)似固體的查詢堿基來(lái)避免錯(cuò)誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針?；贗SS技術(shù)的優(yōu)勢(shì)包括：?jiǎn)渭?xì)胞分辨率、亞細(xì)胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域。缺點(diǎn)是：檢測(cè)效率較低。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果為未來(lái)人類(lèi)心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
來(lái)自10X公司的Visium空間基因表達(dá)解決方案，提供了分析空間整體轉(zhuǎn)錄組的方法。通過(guò)將總mRNA基因表達(dá)數(shù)據(jù)與形態(tài)H&E染色的圖像相疊加，利用Visium，研究人員可以從整個(gè)組織切片和各種各樣的樣本類(lèi)型中獲得整個(gè)轉(zhuǎn)錄組高通量基因表達(dá)分析結(jié)果。該解決方案使研究人員能夠揭示正常和患病組織的生物學(xué)結(jié)構(gòu)，并發(fā)現(xiàn)新的組織生物標(biāo)志物。空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的**是根據(jù)每個(gè)芯片上每個(gè)spot的基因表達(dá)信息進(jìn)行聚類(lèi)，然后將spot根據(jù)坐標(biāo)位置序列放回到組織的圖像上，同時(shí)可以對(duì)每個(gè)gene在組織上表達(dá)的空間位置進(jìn)行定位。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組價(jià)格該類(lèi)工具的開(kāi)發(fā)將簡(jiǎn)化不同類(lèi)型空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的整合和分析。
揭示了溫度影響稻瘟病發(fā)生的分子機(jī)制。歐易生物在本研究中承擔(dān)了空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析工作。全球氣溫變暖對(duì)植物病害的發(fā)生有很大影響，可能導(dǎo)致其分布和流行發(fā)生變化。但對(duì)于溫度如何調(diào)控植物病原***的致病力，宿主植物尤其是作物如何響應(yīng)溫度變化抵御病原***侵染的機(jī)理知之甚少。稻瘟病是由絲狀子囊***Magnaportheoryzae侵染引起的，是水稻**嚴(yán)重的病害之一，植物*****病害**。多年田間調(diào)查表明，24-26°C及以下稻瘟病容易流行，但當(dāng)溫度達(dá)到28-30°C及以上時(shí)稻瘟病的發(fā)生***減少，但其分子機(jī)制尚不清楚。
10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcoded spots），每個(gè)點(diǎn)的直徑為55 μm，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100 μm，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列，然后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建并進(jìn)行測(cè)序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來(lái)自哪個(gè)位置，從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn)，致力通過(guò)高效的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類(lèi)：機(jī)械和光學(xué)。
單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化平臺(tái) 目前， 8種空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，這些數(shù)據(jù)來(lái)自5個(gè)物種，包括人類(lèi)、小鼠、果蠅、秀麗隱桿蟲(chóng)線和斑馬魚(yú)。研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)這些數(shù)據(jù)集進(jìn)行了整合中統(tǒng)計(jì)描述的轉(zhuǎn)錄組技術(shù)研究團(tuán)隊(duì)從論文中提取了每種技術(shù)的簡(jiǎn)要說(shuō)明和示意圖，并研讀了每個(gè)數(shù)據(jù)集的原始論文，提取相應(yīng)的元數(shù)據(jù)，包括出版信息、數(shù)據(jù)描述、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣本和數(shù)據(jù)可用性等。單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組于數(shù)據(jù)集中來(lái)自不同組織、處理方法的樣本或生物技術(shù)復(fù)制品，研究團(tuán)隊(duì)將其手動(dòng)劃分為305個(gè)子數(shù)據(jù)集。所有收集的數(shù)據(jù)集和研究結(jié)果均有文章發(fā)表?？捎糜诳梢暬捅容^空間分辨下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)提供的空間差異表達(dá)基因及豐富的功能注釋，有助于進(jìn)一步數(shù)據(jù)分析。組織細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)提供了一個(gè)資源庫(kù)，并為了解疾病中的細(xì)胞微環(huán)境帶來(lái)新的見(jiàn)解。目前，空間轉(zhuǎn)錄組可從獲得，無(wú)需注冊(cè)或登錄。人類(lèi)細(xì)胞圖譜計(jì)劃的主要目標(biāo)之一是表征所有細(xì)胞類(lèi)型的空間關(guān)系，同時(shí)基于表達(dá)特征在空間上映射多種細(xì)胞類(lèi)型可能的相互作用?？臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在進(jìn)行 HE 染色的同時(shí)需要保證獲取組織基因表達(dá)信息。江西生物技術(shù)空間轉(zhuǎn)錄組
在未來(lái)的5-10年里，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)妥妥的是技術(shù)熱點(diǎn)。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的如火如荼，伴隨著空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的蓬勃發(fā)展，可以看到，在現(xiàn)有的高通量檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，這兩種技術(shù)已為科學(xué)研究的發(fā)展提供了前所未有的技術(shù)支撐。從2019年單細(xì)胞多組學(xué)被評(píng)為《Nature Methods》年度技術(shù)進(jìn)展，到2020年空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)也被評(píng)為年度技術(shù)進(jìn)展，相信在接下來(lái)的時(shí)間里，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組將為生命科學(xué)的發(fā)展做出極其重要的貢獻(xiàn)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的特點(diǎn)在于提供詳實(shí)的每個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄表達(dá)信息，但是缺失了來(lái)源組織的空間組成信息?，F(xiàn)有商用空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的特點(diǎn)在于提供了完整的組織空間位置信息，但是每個(gè)捕獲spot的信息無(wú)法達(dá)到單細(xì)胞分辨率（10個(gè)左右細(xì)胞）。因此，這兩個(gè)技術(shù)的存在是天然互補(bǔ)的，而將兩者的結(jié)合也是水到渠成，完美結(jié)合。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢，是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。（依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)，具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn)）一般項(xiàng)目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品）的研發(fā)、銷(xiāo)售，儀器儀表的銷(xiāo)售，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，會(huì)務(wù)服務(wù)，企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì)，以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務(wù)，科研檢測(cè)，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路，既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng)，又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場(chǎng)需求，提高產(chǎn)品價(jià)值，是我們前行的力量。