法國(guó)賽默飛數(shù)字PCR技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-01-31

使用ddPCR的一個(gè)主要優(yōu)點(diǎn)在于,定量不是相對(duì)的。微滴式數(shù)字PCR計(jì)算事件的數(shù)量,因此可以確定檢測(cè)極限和比較低起始量,以便達(dá)到所需的靈敏度。在連續(xù)監(jiān)控或比較不同患者的效果時(shí),這可以更準(zhǔn)確地比較負(fù)荷,因?yàn)樗鶞y(cè)得的豐度不是相對(duì)的。經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)證實(shí),ddPCRKRASG12/G13ScreeningKit也能夠檢測(cè)患者cfDNA樣品中的KRAS突變(圖2)。這些患者的血漿樣品購(gòu)自ConversantBio和ProMedDx,之前已通過(guò)FFPE基因分型被分為KRAS突變陽(yáng)性或陰性。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。數(shù)字PCR是定量技術(shù),基于單分子PCR方法來(lái)進(jìn)行計(jì)數(shù)的核酸定量,是一種定量的方法。法國(guó)賽默飛數(shù)字PCR技術(shù)

數(shù)字PCR產(chǎn)品的發(fā)展,為不同場(chǎng)景下的多樣化核酸檢測(cè)需求提供了新的思路,尤其是在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)方面,在 性疾病早期檢測(cè)、病癥的液體活檢、無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢查等領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。實(shí)現(xiàn) 性疾病早期高效檢測(cè)——以病毒為例,有病毒檢測(cè)、和臨床樣本病毒載量評(píng)估He監(jiān)測(cè)環(huán)境病毒載量;二代熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù)是目前病毒檢測(cè)的"金標(biāo)準(zhǔn)",但由于病毒探針結(jié)合位點(diǎn)突變、樣本病毒載量不足等原因,在臨床檢測(cè)過(guò)程中經(jīng)常出現(xiàn)假陰性結(jié)果,由于數(shù)字PCR具有更高的靈敏度、精細(xì)度,以及其適合痕量樣本檢測(cè)的特性,能夠檢測(cè)出熒光定量PCR檢測(cè)過(guò)程中錯(cuò)過(guò)的 ,可作為后者的補(bǔ)充。在人群篩查及臨床診療中,為科學(xué)選取采樣方式,需要評(píng)估不同臨床樣本病毒載量,如鼻咽拭子、血尿、糞便、肺泡灌洗液等,由于數(shù)字PCR可提供一定程度上量化指標(biāo),為采樣方法的選取提供了參考,從而提高檢出率。在外防輸入的戰(zhàn)略要求下,環(huán)境病毒檢測(cè)工作尤為重要,數(shù)字PCR可對(duì)低核酸豐度樣本進(jìn)行有效檢測(cè),包括從不同環(huán)境中取樣的樣本,如病房、醫(yī)院衛(wèi)生間、實(shí)驗(yàn)室等等,在病情防控中起到了不可忽視的作用。此外,數(shù)字PCR的應(yīng)用場(chǎng)景還有病程不同階段的病毒載量評(píng)估、核酸參考品制備、抗病毒藥物研發(fā)等環(huán)節(jié)。廣州全自動(dòng)數(shù)字PCR解決方案全自動(dòng)數(shù)字PCR平臺(tái),讓數(shù)字PCR真正邁入新時(shí)代,助推數(shù)字PCR普及應(yīng)用。

產(chǎn)物越短,往往擴(kuò)增效率越高。模板二級(jí)結(jié)構(gòu)(Templatesecondarystructure):PCR變性中和變性后的單鏈DNA不夠穩(wěn)定,容易自發(fā)折疊形成二級(jí)結(jié)構(gòu)。應(yīng)避免可形成穩(wěn)定二級(jí)結(jié)構(gòu)的模板鏈區(qū)域,因?yàn)槿绻0彐溞纬傻亩?jí)結(jié)構(gòu)在退火溫度下穩(wěn)定存在,定位在模板鏈二級(jí)結(jié)構(gòu)處的引物將無(wú)法同模板鏈相結(jié)合。使用mfold可預(yù)測(cè)引物待結(jié)合的區(qū)域是否存在復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)。設(shè)計(jì)引物時(shí),盡量使引物定位在模板二級(jí)結(jié)構(gòu)以外的序列上。避免具有4個(gè)以上相同的連續(xù)堿基的區(qū)域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸階段聚合酶“滑動(dòng)(PolymeraseSlippage)”。選擇GC含量(GCContent)在50-60%之間的區(qū)域。如果高GC含量區(qū)域不可避免,可以嘗試提高退火溫度,并使用添加劑,例如甘油,

常規(guī)PCR和實(shí)時(shí)熒光PCR定量檢測(cè)都需要已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA制定標(biāo)準(zhǔn)曲線,由于樣品測(cè)定在各種條件上不會(huì)完全一致,會(huì)造成PCR擴(kuò)增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而ddPCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)影響,可以進(jìn)行定量。如何在雙通道設(shè)置及雙探針標(biāo)記的情況下實(shí)現(xiàn)多重檢測(cè)?不同位點(diǎn)的雙探針檢測(cè)體系中引物和探針采用不同的終濃度,這樣陽(yáng)性微滴的終點(diǎn)FAM/HEX熒光信號(hào)強(qiáng)度就會(huì)不同,利用陽(yáng)性微滴不同的“分簇(cluster)”來(lái)區(qū)分不同的突變位點(diǎn)。采用對(duì)應(yīng)的KRAS野生型和突變型細(xì)胞系對(duì)雙重ddPCR檢測(cè)體系的性能進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示除了Q61H位點(diǎn)外,其他位點(diǎn)的檢測(cè)體系在54C的情況下均能很好的區(qū)分4個(gè)明顯的cluster。楊雁峰博士堅(jiān)信數(shù)字PCR是可以應(yīng)用于無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查的理想技術(shù)之一,這也是他2016年創(chuàng)立塔歌生物的初衷。

數(shù)字PCR的引物和探針設(shè)計(jì)規(guī)則同熒光定量PCR是類似的,具體規(guī)則如下:1、查找和選擇目標(biāo)序列設(shè)計(jì)引物和探針的第一步是得到感興趣基因的核酸序列。找到基因保守區(qū)域:基因的保守區(qū)域是指來(lái)自同一屬/種/亞型的、在某個(gè)基因上堿基序列差別很小或沒(méi)有差別的區(qū)域。根據(jù)需要,使用ClustalX或ClustalW等軟件對(duì)齊屬于同一屬/種/亞型的基因的一組序列,在對(duì)齊序列的保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,并確保引物結(jié)合位點(diǎn)處的保守序列與其它非待檢測(cè)的屬/種/亞型的堿基序列具有較大的差異。擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度(AmpliconLength):可在75-200bp之間(產(chǎn)物長(zhǎng)度=下游引物位置-上游引物位置+1)。在使用dPCR進(jìn)行轉(zhuǎn)基因檢測(cè)時(shí),通常直接參照qPCR的方法。深圳賽默飛數(shù)字PCR價(jià)格

dPCR的結(jié)果統(tǒng)計(jì)方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)處理方法。法國(guó)賽默飛數(shù)字PCR技術(shù)

PCR已成為分子診斷領(lǐng)域重要的技術(shù)手段之一,占據(jù)分子診斷市場(chǎng)的半壁江山。數(shù)字PCR是一代PCR技術(shù),也是當(dāng)前靈敏度和定量精度比較高的分子檢測(cè)技術(shù)。但數(shù)字PCR使用成本仍然相對(duì)較高,檢測(cè)靶點(diǎn)數(shù)少(一般≤6靶點(diǎn)/反應(yīng)),阻礙了其在臨床中的大規(guī)模應(yīng)用,提高數(shù)字PCR的多重檢測(cè)能力迫在眉睫。基于熒光通道數(shù)的增加和基于探針濃度梯度增加,均可以在一定程度上提高數(shù)字PCR檢測(cè)重?cái)?shù),然而只能達(dá)到"線性"增加的目的?;谔结槤舛忍荻鹊亩嘀貦z測(cè)技術(shù)雖然光'f明顯增加多重能力,但由于無(wú)法避免交叉反應(yīng)現(xiàn)象,不能確保獲得位點(diǎn)特異性的分簇,因此穩(wěn)定性不足、靈敏度較差,難以滿足臨床級(jí)別的數(shù)據(jù)要求。而基于創(chuàng)新的且數(shù)字PCR獨(dú)特適用的熒光編碼技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)“指數(shù)”級(jí)的多重檢測(cè),顛覆性的提高數(shù)字PCR檢測(cè)重?cái)?shù),覆蓋臨床應(yīng)用多場(chǎng)景需求。法國(guó)賽默飛數(shù)字PCR技術(shù)

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