Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析:免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質。
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免疫沉淀實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數據和客戶評價,以幫助做出決策。
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ChIP實驗的基本步驟包括:
1. 交聯(lián)(Crosslinking):細胞被甲醛等交聯(lián)劑處理,使得蛋白質和DNA之間的相互作用被固定,形成穩(wěn)定的蛋白質-DNA復合物。
2. 細胞裂解:裂解細胞,釋放染色質,同時保持蛋白質-DNA復合物的完整性。
3. 超聲或酶解:通過超聲或酶解將染色質切割成較小的片段,以便于后續(xù)步驟中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀(Immunoprecipitation):加入針對特定組蛋白修飾或轉錄因子的抗體,這些抗體會特異性地結合到目標蛋白質上。
5. 捕獲復合物:使用蛋白A或蛋白G結合的珠子捕獲抗體-蛋白質-DNA復合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和DNA片段。
7. 逆轉錄交聯(lián):將捕獲的復合物從珠子上洗脫,并進行逆轉錄交聯(lián),使固定的蛋白質-DNA復合物分離。
8. DNA純化:純化從免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析:通過qPCR、芯片分析(ChIP-chip)或高通量測序(ChIP-seq)等方法分析沉淀的DNA片段,以確定特定蛋白質在基因組上的結合位點。
“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的結合蛋白,進行小規(guī)模的蛋白質親和純化的實驗。更確切地說,IP是采用固定在微珠支持物(一般是瓊脂糖樹脂)上的特定抗體,從復雜的混合物中,純化單一抗原的實驗。固定化蛋白質復合物的組裝既可以分步進行,也可以一步完成。
常見的加樣順序:抗體和樣本(如細胞裂解物)一起孵育,然后加入親和微珠,用于捕獲抗體-抗原復合物。也可以將抗體和微珠(通過抗體結合蛋白,如蛋白A、G或A/G等,直接或間接結合抗體)先進行孵育,然后再加入含有抗原的樣本。當抗原、抗體和固相支持物產生結合以后,充分洗滌微珠,再采用適當的洗脫緩沖液從支持物上洗脫抗原。
免疫沉淀技術IP的原理是什么?
免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過免疫沉淀(Co-IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數據和客戶評價,以幫助做出決策。
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免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種利用抗體與特定蛋白質結合的特性,從復雜樣本中分離和純化目標蛋白質的實驗方法。這項技術在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應用場景,以下是一些主要的應用領域:
1. 蛋白質相互作用分析:通過免疫沉淀技術,研究人員可以研究蛋白質之間的相互作用,揭示蛋白質復合物的組成以及它們在細胞內的功能和調控機制。
2. 抗體藥物開發(fā):免疫沉淀技術可以用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性,指導抗體藥物的設計和優(yōu)化。
3. 蛋白質表達水平分析:通過比較不同條件下的免疫沉淀結果,可以評估目標蛋白的相對量,進而研究蛋白質的表達調控。
4. 染色質免疫沉淀(ChIP):這是一種特殊的免疫沉淀技術,用于研究蛋白質與DNA的相互作用,如轉錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結合情況。
5. RNA免疫沉淀(RIP):類似于ChIP,RIP用于研究RNA結合蛋白與RNA分子之間的相互作用。
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