武漢定量蛋白組學(xué)研究方法

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程是怎樣的？要做PRM首先要明確目標(biāo)蛋白（或多肽）是什么，設(shè)計(jì)和建立針對(duì)這些目標(biāo)蛋白PRM質(zhì)譜采集方法，然后對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行PRM數(shù)據(jù)采集，將得到的原始譜圖數(shù)據(jù)導(dǎo)入分析軟件提取子離子信息進(jìn)行定量。另外，如果配制已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)肽段，用PRM額外做一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線，即可實(shí)現(xiàn)一定的定量。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)能應(yīng)用到哪些方面？研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過PRM技術(shù)來實(shí)現(xiàn)。具體說來，比如驗(yàn)證定量蛋白質(zhì)組學(xué)中某些蛋白的變化，多肽的相對(duì)和一定的定量，想做蛋白定量卻沒有抗體，針對(duì)蛋白修飾位點(diǎn)的定量，想同時(shí)定量多個(gè)蛋白的情況等，都可以用PRM來做。蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng)，也是一個(gè)整體的概念。武漢定量蛋白組學(xué)研究方法

LabelFree(非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù))：在非標(biāo)記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎(chǔ)，通過比較一對(duì)生物樣品中相對(duì)應(yīng)到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對(duì)豐度；其二，以肽段被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)為基礎(chǔ)，通過歸一化來表征被檢測(cè)蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度。非標(biāo)記技術(shù)認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測(cè)的頻率（Counts）與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測(cè)的計(jì)數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測(cè)計(jì)數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來，從而對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。哈爾濱蛋白質(zhì)組學(xué)費(fèi)用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)成為現(xiàn)代的生物技術(shù)快速發(fā)展的重要支撐。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：產(chǎn)品分類：a.相對(duì)定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：（1）無需抗體，可直接對(duì)樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析。（2）高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度，靶向檢測(cè)目標(biāo)蛋白對(duì)應(yīng)的多個(gè)unique肽段。（3）通量高，可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)幾十個(gè)蛋白的定量檢測(cè)。樣本要求：動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本100mg/sample，血清、血漿200μL/sample，細(xì)胞、微生物1×107cells/sample。應(yīng)用方向：驗(yàn)證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果；目標(biāo)蛋白相對(duì)定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究，針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：特點(diǎn)：（1）不同樣本標(biāo)記之后混樣，統(tǒng)一處理上機(jī)，減少了分別上機(jī)造成的實(shí)驗(yàn)誤差，并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測(cè)，定量更準(zhǔn)確，重復(fù)性更好；（2）由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記，因此成本相對(duì)較高；（3）通量高，在一次實(shí)驗(yàn)中比較多可同時(shí)比較8個(gè)樣品；（4）利用基于同一個(gè)參考樣品的辦法，可以進(jìn)行多于8個(gè)樣品的定量比較；（5）iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：Label-Free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對(duì)比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。

蛋白質(zhì)組學(xué)：對(duì)人類而言，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康，主要指促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質(zhì)，而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預(yù)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和疾病機(jī)理研究中，了解人不同發(fā)育、生長(zhǎng)期和不同生理、病理?xiàng)l件下及不同細(xì)胞類型的基因表達(dá)的特點(diǎn)具有特別重要的意義。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關(guān)的分子，進(jìn)一步為設(shè)計(jì)作用于特定靶分子的藥物奠定基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組學(xué)包括翻譯后的修飾。濟(jì)南外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。武漢定量蛋白組學(xué)研究方法

蛋白質(zhì)組學(xué)概念：蛋白質(zhì)組學(xué)（英語：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組（Proteome）一詞，源于蛋白質(zhì)（protein）與基因組（genome）兩個(gè)詞的組合，意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。武漢定量蛋白組學(xué)研究方法

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