貴州DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)：TMT(TandemMassTags)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)采用多個（2-10）穩(wěn)定同位素標(biāo)簽，特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán)進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析，能夠同時比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量，可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)是多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)相似，可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？貴州DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記（label）和非標(biāo)記（labelfree）定量策略，標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中，常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。非標(biāo)記（labelfree）的定量蛋白組學(xué)技術(shù)，Labelfree定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強(qiáng)度，從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對定量。南京醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)項目蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：特點：（1）不同樣本標(biāo)記之后混樣，統(tǒng)一處理上機(jī)，減少了分別上機(jī)造成的實驗誤差，并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測，定量更準(zhǔn)確，重復(fù)性更好；（2）由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記，因此成本相對較高；（3）通量高，在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品；（4）利用基于同一個參考樣品的辦法，可以進(jìn)行多于8個樣品的定量比較；（5）iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：Label-Free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。

非標(biāo)定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強(qiáng)度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標(biāo)記方法，發(fā)展比較早，已經(jīng)形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ)，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標(biāo)記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ)，計算每個肽段的信號強(qiáng)度在LC-MS上的積分。蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng)，也是一個整體的概念。

我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學(xué)呢？抗體免疫的方法呢，其實就是ELISA，Western及蛋白質(zhì)芯片。通過合成大量蛋白質(zhì)特異的抗體，能夠進(jìn)行定性檢測及相對定量分析，只要你有好用的抗體，那么就可以通過免疫反應(yīng)讓抗體快速的識別你感興趣的蛋白質(zhì)，然后用例如HRP發(fā)光等標(biāo)記方法顯示它們是否存在于你的樣品當(dāng)中。現(xiàn)在已有的抗體不只能識別特定蛋白質(zhì)，還能識別特定修飾的特定蛋白質(zhì)或者被特定修飾過的特定蛋白質(zhì)Motif。蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng)，也是一個整體的概念。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來看），就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。河南蛋白質(zhì)定量組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。貴州DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究

定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義：從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開對細(xì)胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達(dá)量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究，識別功能模塊和路徑，監(jiān)控疾病的生物標(biāo)志物，這些研究都需要對蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析提供了更可靠、動態(tài)范圍更廣的研究手段?；谫|(zhì)譜技術(shù)，科學(xué)家們不斷開發(fā)出新的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，來了解細(xì)胞、組織或生物體的整體蛋白質(zhì)動力學(xué)。貴州DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究

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