貴州蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-10

蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,從而檢測(cè)蛋白質(zhì)或者多肽上位點(diǎn)發(fā)生何種修飾。可檢測(cè)修飾類(lèi)型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;⒍□;?、丙二?;⑽於;?、琥珀酰化、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理等;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等;3、乙?;夯虮磉_(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等;5、甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;6、丙?;?/ 丙二酰化 / 戊二?;?/ 琥珀酰化:主要存在于線粒體和細(xì)菌中,與代謝過(guò)程密切相關(guān)。乙酰化修飾是體內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。貴州蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類(lèi)高度保守的蛋白質(zhì),是染色質(zhì)的關(guān)鍵成分,是DNA包裝的結(jié)構(gòu)單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導(dǎo)。組蛋白翻譯后修飾包括通過(guò)絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴(lài)氨酸或精氨酸的甲基化,賴(lài)氨酸的乙酰化和脫乙?;?,賴(lài)氨酸的泛素化和磺酰化等對(duì)組蛋白進(jìn)行的共價(jià)修飾。組蛋白這些修飾對(duì)于核完整性至關(guān)重要,因?yàn)樗鼈兛梢哉{(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)并募集參與基因調(diào)節(jié)、DNA修復(fù)和染色體濃縮的酶。組蛋白的翻譯后修飾大多位于N末端的尾巴上,因?yàn)镹末端是蛋白質(zhì)中比較暴露和比較靈活的區(qū)域。分析組蛋白翻譯后修飾有助于探索組蛋白修飾與染色體濃縮、DNA轉(zhuǎn)錄等生物功能之間的關(guān)系。廣東蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)價(jià)錢(qián)乙?;揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類(lèi)型。

蛋白磷酸化修飾過(guò)程:蛋白磷酸化修飾這一過(guò)程是通過(guò)蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過(guò)程是可逆的,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測(cè)方法:Western Blot檢測(cè)方法:Western Blot是檢測(cè)蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過(guò)程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,然后使用特異性識(shí)別磷酸化蛋白的抗體來(lái)鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會(huì)在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。

翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)方法:翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)技術(shù)包括有免疫沉淀、western blot、質(zhì)譜技術(shù)、體外生化分析等。其中,免疫沉淀是大多數(shù)翻譯后修飾檢測(cè)中的關(guān)鍵步驟,它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來(lái)富集目標(biāo)蛋白,之后再用western blot或質(zhì)譜技術(shù)分析目標(biāo)蛋白。Western blot和質(zhì)譜技術(shù)均可用于蛋白質(zhì)翻譯后修飾的下游檢測(cè),其中Western blot相對(duì)簡(jiǎn)單但依賴(lài)于特異性抗體且無(wú)法識(shí)別單個(gè)蛋白質(zhì)變化,質(zhì)譜則可以檢測(cè)包括未知PTM在內(nèi)的幾乎所有的PTMs但成本更高需要專(zhuān)業(yè)知識(shí)來(lái)分析產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)。研究人員可以根據(jù)成本、有無(wú)可用抗體,以及有沒(méi)有目標(biāo)等選擇合適的方法進(jìn)行檢測(cè)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價(jià)修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡(jiǎn)單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過(guò)程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動(dòng)的所有過(guò)程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的比較主要的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方式。目前已經(jīng)知道有許多人類(lèi)疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。深圳磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些

蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學(xué)意義?貴州蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)分析

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾:相對(duì)于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù),質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對(duì)蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行分析,且可以對(duì)常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進(jìn)行補(bǔ)充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無(wú)法保證可以完全識(shí)別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因?yàn)橘|(zhì)譜是通過(guò)蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個(gè)肽段來(lái)鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識(shí)別的機(jī)會(huì)。一種提高質(zhì)譜儀檢測(cè)到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進(jìn)行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進(jìn)行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。貴州蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析

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