蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢:技術(shù)發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,各有優(yōu)勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強調(diào)各種方法間的整合和互補,以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外,蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源,特別是,蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)??茖W如基因組學,生物信息學等領(lǐng)域的交叉,構(gòu)成組學(omics)生物技術(shù)研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(SystemBiology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容。上海蛋白質(zhì)定量組學研究
Labelfree非標記定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)特點:(1)不需要標記處理,操作簡單,成本低、實驗周期短;(2)每個樣品單獨處理、上機;(3)可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,樣品類型不受限制;(4)對單個樣品的蛋白總量要求相對較低,對于組織本身蛋白量不高,可以選擇Label-Free,適用于一些難收集樣品;(5)定性沒有問題,但是定量的準確性較標記定量稍差,會受到質(zhì)譜穩(wěn)定性等因素的影響;(6)適合于大樣本量的定量比較(大于24個樣本)。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。外泌體蛋白質(zhì)組學蛋白質(zhì)組的研究能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。
常規(guī)蛋白質(zhì)組學:Labelfree多肽組學:顧名思義,就是不使用任何標記方法,直接對肽段進行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單,只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種:峰面積(Peakintensity)和峰計數(shù)(Spectralcount),常用的是峰面積。不過,由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測,所以會丟失一些豐度較低的肽段信息,缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學:TMT全稱是TandemMassTag,是經(jīng)典化學標記試劑,普遍用于差異表達蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術(shù)采用6重、10重或16重同位素標簽,與肽段的氨基發(fā)生共價結(jié)合反應(yīng),可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。(目前16標鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù))。
蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。labelfree-非標定量法分析技術(shù)方法:非標定量法[Labelfree]是近年來重要的質(zhì)譜定量方法,通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度,分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化。蛋白質(zhì)非標記定量技術(shù)(LabelFree)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度,從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?/p>
蛋白質(zhì)組(Proteome)的概念指由一個基因組(genome),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)(Protein).蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變.在轉(zhuǎn)錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以許多形式進行翻譯后的修飾.故一個蛋白質(zhì)組不是一個基因組的直接產(chǎn)物,蛋白質(zhì)組中蛋白質(zhì)的數(shù)目有時可以超過基因組的數(shù)目.蛋白質(zhì)組學(Proteomics)處于早期“發(fā)育”狀態(tài),這個領(lǐng)域的**否認它是單純的方法學,就像基因組學一樣,不是一個封閉的、概念化的穩(wěn)定的知識體系,而是一個領(lǐng)域.蛋白質(zhì)組學集中于動態(tài)描述基因調(diào)節(jié),對基因表達的蛋白質(zhì)水平進行定量的測定,鑒定疾病、藥物對生命過程的影響,以及解釋基因表達調(diào)控的機制.作為一門科學。蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。貴州定量乙?;鞍踪|(zhì)組學質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)組學技術(shù)有生物質(zhì)譜。上海蛋白質(zhì)定量組學研究
蛋白質(zhì)組學技術(shù):生物質(zhì)譜:生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術(shù),其基本原理是樣品分子離子化后,根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質(zhì)譜進行鑒定與分析。目前常用的質(zhì)譜包括兩種:基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質(zhì)譜(ESI-MS)。蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。上海蛋白質(zhì)定量組學研究
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