南京蛋白質糖基化修飾組學領域

來源: 發(fā)布時間:2021-12-31

質譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于蛋白質印跡等技術,質譜技術能更有效的對蛋白質的翻譯后修飾進行分析,且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因為質譜是通過蛋白質序列內的多個肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質的翻譯后修飾調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。南京蛋白質糖基化修飾組學領域

蛋白質磷酸化修飾組學:磷酸化蛋白質是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團轉移到底物蛋白特定的氨基酸側鏈上形成的。蛋白質磷酸化是一種可逆的蛋白質翻譯后修飾。在哺乳動物的細胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白質發(fā)生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號轉導途徑和細胞代謝過程,且許多已知的疾病也與蛋白質的異常磷酸化有關。因此,對磷酸化蛋白質組進行定量研究,尋找差異表達的磷酸化蛋白質,有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標。南京蛋白質糖基化修飾組學領域蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。

蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。

蛋白質-蛋白質相互作用是蛋白質發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發(fā)生.在蛋白質的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?;?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質的電性,疏水性和空間結構等屬性,為與之結合的蛋白提供結合的錨定或產(chǎn)生位阻效應,像一把開關在時空上精確調控蛋白質-蛋白質相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結構研究表明,蛋白質之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設計抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙?;⒎核鼗?、丙?;?、丁?;?、丙二?;?。

蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質翻譯后修飾的策略,包括質譜(MS)、Eastern blotting、放射性標記和Western blotting。放射性標記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對定量的方法。該過程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質譜技術也常被用于翻譯后修飾分析,不受修飾類型和相關修飾位點的現(xiàn)有知識的限制。自下而上:自下而上的技術是蛋白質組學研究中使用的質譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白質。由于該技術不能保證在檢測過程中被檢測肽的完整性和穩(wěn)定性,因此無法獲得不同蛋白質翻譯后修飾之間關系的信息,這意味著它無法檢測到某些修飾。因此,該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。常見的蛋白質翻譯后修飾包括糖基化。深圳丙二?;揎椀鞍踪|組學服務

蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合。南京蛋白質糖基化修飾組學領域

乙酰化修飾蛋白質組學分析:乙?;揎椀鞍踪|組學分析是指從蛋白質組學的水平分析蛋白質乙?;揎?,包括乙酰化蛋白質的鑒定和定量。提供基于質譜的乙酰化蛋白組研究服務。蛋白質乙?;ńM蛋白乙?;头墙M蛋白乙?;=M蛋白乙?;饕琴嚢彼嵋阴;言诨蜣D錄調控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙?;瘶嫵闪瞬溉閯游锛毎幸阴;鞍椎闹饕糠?,參與了所有主要生物過程,包括蛋白質的定位、轉移、功能和降解,遺傳物質的轉錄和復制等。除了重要的生物學功能以外,乙酰化蛋白質及其調控酶還與衰老和多種疾?。ㄈ缟窠?jīng)變形紊亂、心血管疾病等)緊密相關。因此,對乙?;揎椀鞍踪|組進行研究有助于進一步探索細胞的生命活動與了解相關疾病的發(fā)病機制。南京蛋白質糖基化修飾組學領域

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