廣東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-22

代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有:臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個(gè)或多個(gè)瞬時(shí)狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動(dòng)。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請(qǐng)參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢。廣東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個(gè)樣本量如下:(1) 微生物和細(xì)胞樣本:細(xì)胞迅速猝滅細(xì)胞并冷凍保存;單個(gè)樣本細(xì)胞數(shù)量要求10^6。(2) 動(dòng)物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血?jiǎng)⒎栏瘎?,并立即冷凍處理?80 ℃);單個(gè)樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個(gè)樣本要求質(zhì)量為50mg。杭州代謝組學(xué)定性分析代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000)。

代謝組學(xué)發(fā)展前景:代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”,每年發(fā)表的代謝組學(xué)研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速,盡管還沒有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過市場研究發(fā)現(xiàn),健康人并不希望進(jìn)行基因型分析,所以,對(duì)于這些人群來說,基因組學(xué)研究在臨床上的應(yīng)用很有限。而代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似,且相對(duì)于基因組學(xué)來說,提供的個(gè)人信息更少,故其在臨床上的應(yīng)用有可能產(chǎn)生一定的影響。

代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因?yàn)榇x物大多數(shù)都不是高沸點(diǎn)的,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點(diǎn)物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,一方面是NMR這個(gè)東西入行起點(diǎn)有點(diǎn)高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對(duì)于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對(duì)定性非常有用,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。

代謝組學(xué)如何控制臨床樣本的質(zhì)量?對(duì)于臨床的樣本建議每組比較低的25個(gè)生物學(xué)重復(fù),達(dá)到30例以上比較好。因?yàn)榕R床樣本受外界環(huán)境和遺傳背景影響較大,需要很多生物學(xué)重復(fù)來消除這些外在影響。此外,在樣本收集過程中,應(yīng)保持收養(yǎng)的時(shí)間段和操作程序盡可能一致。代謝組學(xué)樣本收集取樣基本原則:表示性和一致性:驗(yàn)組與對(duì)照組樣本在取材部位、時(shí)間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實(shí)驗(yàn)的可信度;迅速性:操作過程迅速,很大限度縮短樣本采集到實(shí)驗(yàn)的時(shí)間;低溫原則:所有樣本離體后,分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進(jìn)行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產(chǎn)生進(jìn)一步代謝活動(dòng)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。廣東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析

代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。廣東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析

代謝組學(xué)發(fā)展前景:較低的費(fèi)用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個(gè)原因。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低,研究人員可以通過代謝組學(xué)研究篩檢出代謝產(chǎn)物,然后采用更昂貴的基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的方法對(duì)有意義的代謝產(chǎn)物進(jìn)一步加以研究。首先,必須識(shí)別出代謝產(chǎn)物,這并不是簡單的工作。代謝組學(xué)研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對(duì)代謝產(chǎn)物的識(shí)別,這也是比較有趣的方面,而更具挑戰(zhàn)性的工作,是進(jìn)一步確認(rèn)所有代謝物的功能。此外,質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高,由于缺乏均勻性,使色譜分析變得更加困難,無法識(shí)別出樣品中的未知物質(zhì)。廣東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析

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