代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用
代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:懸浮細(xì)胞:1)連同培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移到1.5 mL的進(jìn)口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細(xì)胞沉淀于離心管的底部(1*107個(gè)細(xì)胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預(yù)冷的PBS反復(fù)沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標(biāo)記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細(xì)胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項(xiàng):1. 培養(yǎng)基傾倒時(shí)盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請(qǐng)使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細(xì)胞時(shí),請(qǐng)小心避免離心管破碎導(dǎo)致樣本受損;4. 建議細(xì)胞樣本在進(jìn)行培養(yǎng)時(shí)多準(zhǔn)備樣本,以備后續(xù)使用。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)是用來解決什么問題的呢?
代謝組學(xué)有哪些應(yīng)用?近年來,代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展,主要可應(yīng)用于:功能基因組學(xué)、疾病早期診斷、病因病機(jī)研究、藥物毒理學(xué)、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學(xué)、微生物代謝組學(xué)、營養(yǎng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)等生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。為什么要選擇代謝組學(xué)?首先需要明確的是代謝組學(xué)的目標(biāo)分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖、有機(jī)酸、脂質(zhì)、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關(guān)注的是小分子物質(zhì),那么采用代謝組學(xué)的方法,可以對(duì)樣品內(nèi)檢測到的小分子物質(zhì)進(jìn)行定性、定量分析。同于基因組學(xué)和蛋白組學(xué),代謝組學(xué)的研究反映某一時(shí)刻下正在發(fā)生的生命活動(dòng)情況,研究代謝物的表達(dá)量、代謝物與生理病理變化的關(guān)系,能夠幫助尋找新的生物標(biāo)記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進(jìn)一步深入了解目前已知的這些途徑,應(yīng)用于疾病的早期診斷、藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。
選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?1、代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2、小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。3、代謝物的種類少,大約在103個(gè)數(shù)量級(jí),要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,分析起來更簡單明了。4、代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜。5、基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。6、代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。代謝組學(xué)在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。
代謝組學(xué)概念:基因與蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連,而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境,這又與細(xì)胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為,“基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生,而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了。”代謝組學(xué)的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學(xué)則是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo)的系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)分支。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。貴州代謝組學(xué)
代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后其代謝產(chǎn)物種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用
代謝組學(xué)的功能:代謝組學(xué)的功能,就有點(diǎn)類似GPS。代謝組學(xué)不做任何假設(shè),針對(duì)樣本和參照物分別進(jìn)行代謝物全譜檢測,幫你尋找出與差異代謝物,可能會(huì)有好幾十個(gè)甚至更多,從它們所在的被上調(diào)或下調(diào)的代謝通路上去找到關(guān)鍵的代謝酶,再找到它們上游的調(diào)控基因,再進(jìn)行后續(xù)的深入研究,是不是可以避免走一些彎路?可以說代謝組學(xué)是一個(gè)相當(dāng)有效率的研究工具。代謝組學(xué)在生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),疾病早期診斷和預(yù)測,藥物或營養(yǎng)干預(yù)的評(píng)價(jià),藥物毒性評(píng)價(jià),代謝工程研究中均有應(yīng)用,但代謝組學(xué)只是一個(gè)“檢測平臺(tái)”,它無法單獨(dú)開展機(jī)制性研究,但是如果合理的將代謝組學(xué)與分子生物學(xué)等學(xué)科協(xié)同使用,就可以起到事半功倍的作用。武漢LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)費(fèi)用