蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學(xué)分析？目前一般文獻(xiàn)中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類(lèi)分析、蛋白質(zhì)功能分析（GO分類(lèi)為主）、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析（基于KEGG的pathway）、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)等方面。其它一些比較特異的高級(jí)分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預(yù)測(cè)分析、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記（label）和非標(biāo)記（labelfree）定量策略，標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動(dòng)態(tài)變化對(duì)各種生命過(guò)程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中，常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將推動(dòng)新技術(shù)、新方法的發(fā)展。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
蛋白質(zhì)組學(xué)（英語(yǔ)：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類(lèi)健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益，是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ)，是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動(dòng)的執(zhí)行者，亦是基因功能活動(dòng)的之后的執(zhí)行者，是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識(shí)別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式，是對(duì)基因組研究的重要補(bǔ)充，是對(duì)生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動(dòng)態(tài)、整體性的研究。這類(lèi)研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律，為疾病的診斷、疫苗及新藥開(kāi)發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對(duì)象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍。
蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)處于早期“發(fā)育”狀態(tài)，這個(gè)領(lǐng)域的**否認(rèn)它是單純的方法學(xué)，就像基因組學(xué)一樣，不是一個(gè)封閉的、概念化的穩(wěn)定的知識(shí)體系，而是一個(gè)領(lǐng)域.蛋白質(zhì)組學(xué)集中于動(dòng)態(tài)描述基因調(diào)節(jié)，對(duì)基因表達(dá)的蛋白質(zhì)水平進(jìn)行定量的測(cè)定，鑒定疾病、藥物對(duì)生命過(guò)程的影響，以及解釋基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制.作為一門(mén)科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段，當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景意義：從生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開(kāi)對(duì)細(xì)胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類(lèi)和表達(dá)量的研究。對(duì)處不同時(shí)期、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究，識(shí)別功能模塊和路徑，監(jiān)控疾病的生物標(biāo)志物，這些研究都需要對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析提供了更可靠、動(dòng)態(tài)范圍更廣的研究手段。蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)有效的方法之一。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？作為主要研究策略的蛋白質(zhì)組學(xué):這與題目中的描述更相關(guān)些，蛋白質(zhì)組學(xué)是研究中的關(guān)鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言，蛋白質(zhì)組學(xué)在此類(lèi)應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測(cè)手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實(shí)上，在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)Q研究和臨床診斷中，蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來(lái)看)，就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中，需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。蛋白質(zhì)組意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。深圳Label free多肽組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)組和基因組在概念上有相關(guān)性。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)：iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)相似，可研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。Label-free：Label-free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對(duì)比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)