琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組鑒定:蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾是新近發(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是在琥珀酰輔酶 A 的介導(dǎo)下將一個負(fù)電荷四碳琥珀?;D(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程。賴氨酸琥珀?;谡婧思?xì)胞及原核細(xì)胞中普遍存在,參與調(diào)控包括三羧酸循環(huán),氨基酸代謝以及脂肪酸代謝在內(nèi)的多個代謝信號通路。琥珀?;鞍踪|(zhì)組以組織、細(xì)胞等較為復(fù)雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發(fā)生琥珀酰化修飾的蛋白質(zhì)以及相應(yīng)的琥珀?;揎椢稽c。琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過程。貴州蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)費用
泛素化修飾蛋白組學(xué)研究:泛素化修飾蛋白組學(xué)是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進(jìn)行富集以提高其豐度,然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進(jìn)行定量分析。四川亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要方式翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團(tuán)或蛋白質(zhì)的共價添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙酰化、脂質(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機制的所有方面。因此,識別和理解 PTM 在細(xì)胞生物學(xué)和疾病療理和預(yù)防的研究中至關(guān)重要。蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進(jìn)一步促進(jìn)了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加。PTMs 是一種化學(xué)修飾,在功能蛋白質(zhì)組中發(fā)揮關(guān)鍵作用,因為它們調(diào)節(jié)活性、定位以及與其他細(xì)胞分子(如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔助因子)的相互作用。
磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):在有機體內(nèi),磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價修飾形式,同時也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用,該過程是由蛋白質(zhì)激酶(Kinase)催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底物蛋白質(zhì)的氨基酸殘基,如絲氨酸(Serine,Ser,S)、蘇氨酸(Threonine,Thr,T)和酪氨酸(Tyrosine,Tyr,Y)等上的過程,而其逆向過程則是由蛋白質(zhì)磷酸酶去除相應(yīng)的磷酸基團(tuán)。正是這兩種酶的相反作用及其中所涉及到的能量消耗與生成使磷酸化成為體內(nèi)很多生理活動調(diào)控的首先選擇方式。已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾種類有20多種。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)的介紹:泛素由76個氨基酸組成,高度保守,普遍存在于真核細(xì)胞內(nèi),故名泛素。泛素化是可逆的,依賴ATP并且通過泛素刺激酶E1,泛素結(jié)合酶E2,泛素連接酶E3一系列催化反應(yīng)所致。這些特殊的酶包括泛素酶,結(jié)合酶、連結(jié)酶和降解酶等。泛素化在蛋白質(zhì)的定位、代謝、功能、調(diào)節(jié)和降解中都起著十分重要的作用。同時,它也參與了細(xì)胞周期、增殖、凋亡、分化、轉(zhuǎn)移、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。在技術(shù)上,研究翻譯后修飾蛋白的主要挑戰(zhàn)是開發(fā)特異性的檢測和純化方法。武漢糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)方法
樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)。貴州蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)費用
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個賴氨酸殘基的泛素與另一個泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細(xì)胞分裂,自噬,DNA修復(fù),免疫應(yīng)答,細(xì)胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進(jìn)行的蛋白質(zhì)水解不同,從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段,整個水解過程需要能量參與。人們開始意識到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個對于真核細(xì)胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。貴州蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)費用