非靶向代謝組學(xué)分析流程:1、代謝譜分析(也稱(chēng)為差異表達(dá)分析):在一組實(shí)驗(yàn)和對(duì)照樣品中,尋找豐度改變有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的感興趣代謝物;2、鑒定:進(jìn)行代謝譜分析后,測(cè)定這些代謝物的化學(xué)結(jié)構(gòu);3、解釋?zhuān)貉芯苛鞒痰慕Y(jié)尾的一步,解釋所發(fā)現(xiàn)的代謝物與生物過(guò)程或生物狀態(tài)之間的關(guān)聯(lián)。代謝組學(xué)主要是對(duì)生物體受到內(nèi)部(基因)或外部(飲食、環(huán)境等)刺激后所發(fā)生生物響應(yīng)進(jìn)行綜合分析的研究工具,代謝組學(xué)的研究按照研究目的的不同可分為靶向代謝組學(xué)和非靶向代謝組學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑。江蘇LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)的特點(diǎn):1.相對(duì)于其他組學(xué)研究,檢測(cè)技術(shù)相對(duì)簡(jiǎn)單(液-質(zhì)聯(lián)用,氣-質(zhì)聯(lián)用及核磁)2.代謝組學(xué)是體內(nèi)外多種綜合因素的結(jié)果。代謝組學(xué)的應(yīng)用:生物標(biāo)志物尋找,療效的監(jiān)控,疾病分型,中藥研究中的治病機(jī)理,毒副作用評(píng)價(jià)。代謝組學(xué)研究思路:1.?通過(guò)差異分析得到差異代謝物后,對(duì)大樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行KM,ROC,Cox等分析,發(fā)現(xiàn)臨床生存及疾病預(yù)測(cè)價(jià)值。2.?差異代謝物進(jìn)行功能研究,抗代謝物或者是添加外源代謝物,細(xì)胞及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證該代謝物對(duì)表型的重要性。3.?多組學(xué)研究,根據(jù)代謝物找到上游調(diào)控蛋白,對(duì)上游蛋白進(jìn)行研究。山東非靶向代謝組學(xué)分析方法代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。
代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō),不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō),質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過(guò)去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對(duì)象大都是分子量1500Da以?xún)?nèi)的小分子物質(zhì)。LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、較高的靈敏度、分辨率;2、較寬的動(dòng)態(tài)范圍;3、適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定;4、適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究。代謝組學(xué)是在基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門(mén)學(xué)科。
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿(mǎn)了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過(guò)程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過(guò)對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。山東非靶向代謝組學(xué)分析方法
代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”。江蘇LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系?代謝組學(xué)是運(yùn)用多種技術(shù)手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等)的種類(lèi)、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對(duì)生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺(tái)。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因?yàn)槠漭^為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)的特點(diǎn),被大量地運(yùn)用在植物、動(dòng)物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展,運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點(diǎn)的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點(diǎn)、疾病機(jī)制研究和藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。江蘇LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定