南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)一般流程

泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對(duì)酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度，然后通過(guò)高質(zhì)量的泛素化修飾類抗體和生物材料對(duì)修飾肽段進(jìn)行富集，之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：1、高特異性的修飾類泛抗體；2、高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀；應(yīng)用領(lǐng)域：泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖、細(xì)胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。泛素化心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此，作為近年來(lái)生物化學(xué)研究的一個(gè)重大成果，它已然成為研究、開(kāi)發(fā)新藥物的新靶點(diǎn)。已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾種類有20多種。南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)一般流程

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么？泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個(gè)賴氨酸殘基的泛素與另一個(gè)泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過(guò)程中起到重要的作用。共價(jià)結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識(shí)別并降解，這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細(xì)胞分裂，自噬，DNA修復(fù)，免疫應(yīng)答，細(xì)胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進(jìn)行的蛋白質(zhì)水解不同，從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段，整個(gè)水解過(guò)程需要能量參與。人們開(kāi)始意識(shí)到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個(gè)對(duì)于真核細(xì)胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。四川磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)有什么重要的作用呢？

泛素化修飾PRM定量驗(yàn)證：原理： 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng)。首先對(duì)泛素化的蛋白進(jìn)行胰酶消化，在賴氨酸的修飾位點(diǎn)上會(huì)產(chǎn)生兩個(gè)甘氨酸的殘基(K-GG)，利用對(duì)泛素化賴氨酸（K-GG）具有高親和力的基序抗體，特異性富集復(fù)雜樣本中的泛素化肽段，結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法，實(shí)現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽(yáng)離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用，對(duì)樣品進(jìn)行理想的分離。譜識(shí)別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行，但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的問(wèn)題，需要對(duì)結(jié)果進(jìn)行過(guò)濾。自上而下分析策略：自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對(duì)其進(jìn)行片段化，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。蛋白質(zhì)翻譯后修飾發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)產(chǎn)品：常規(guī)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究往往只關(guān)注不同生理、病理?xiàng)l件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而，越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn)，許多重要的生命活動(dòng)、疾病發(fā)生不僅與蛋白質(zhì)的豐度相關(guān)，更重要的是被各類蛋白質(zhì)翻譯后修飾所調(diào)控。因此深入研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾對(duì)揭示生命活動(dòng)的機(jī)理、篩選疾病的臨床標(biāo)志物、鑒定藥物靶點(diǎn)等方面都具有重要意義。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣，質(zhì)譜分析前需要對(duì)修飾進(jìn)行富集以提高其豐度。翻譯后修飾是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過(guò)程。四川磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

乙?；揎椀鞍捉M學(xué)應(yīng)用方向有什么？南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)一般流程

泛素化修飾蛋白組學(xué)研究：泛素化修飾蛋白組學(xué)是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng)。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣，質(zhì)譜分析前需要對(duì)修飾進(jìn)行富集以提高其豐度，然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對(duì)富集得到的泛素化肽段樣品進(jìn)行定量分析。南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)一般流程