GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系?代謝組學(xué)是運(yùn)用多種技術(shù)手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等)的種類(lèi)、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對(duì)生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺(tái)。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因?yàn)槠漭^為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)的特點(diǎn),被大量地運(yùn)用在植物、動(dòng)物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展,運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點(diǎn)的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點(diǎn)、疾病機(jī)制研究和藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。代謝組學(xué)是一個(gè)相當(dāng)有效率的研究工具。濟(jì)南植物靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)分析主要是以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)特定的代謝物群進(jìn)行有針對(duì)性地、特異性地檢測(cè)與分析。通常采用的技術(shù)方案包括常規(guī)的液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析技術(shù)和選擇性反應(yīng)/多反應(yīng)監(jiān)測(cè)技術(shù)(MRM/ SRM)。常規(guī)分析法首先利用LC-MS的方法對(duì)待分析樣本進(jìn)行大規(guī)模代謝組分析,然后通過(guò)與相同分析條件下標(biāo)準(zhǔn)品的分析結(jié)果進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)對(duì)樣本內(nèi)目標(biāo)代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術(shù)是基于已知或假定的反應(yīng)離子信息,有針對(duì)性地選擇數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)采集,對(duì)符合規(guī)則的離子對(duì)進(jìn)行信號(hào)記錄,去除不符合規(guī)則離子信號(hào)的干擾。定量過(guò)程中,該技術(shù)首先篩選到目標(biāo)代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對(duì)這些母離子進(jìn)行碰撞誘導(dǎo),去除其他離子的干擾,只對(duì)選定的特異MS/MS2離子進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)的采集,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)代謝分子更為特異、靈敏、準(zhǔn)確的分析。貴州代謝組學(xué)分析價(jià)格靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。
代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng):(1)血液離開(kāi)動(dòng)物或人體后,應(yīng)盡快開(kāi)展血清、血漿的分離,并嚴(yán)格按照操作說(shuō)明進(jìn)行。(2)采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體,如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色,說(shuō)明在已經(jīng)發(fā)生了了溶血現(xiàn)象,樣本需重新制備。(3)血清與血漿的主要區(qū)別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質(zhì),氨基酸,核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集:1.人糞便:(1)用無(wú)菌勺挖取新鮮的,排泄中后部的內(nèi)側(cè)糞便(避免尿液及其他壁對(duì)樣本污染);(2)分裝樣本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.(4)-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。
為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?1)小分子的產(chǎn)生和代謝是生物機(jī)體作用的結(jié)果,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。2)基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大,從而使檢測(cè)更容易;3)代謝組學(xué)的代謝物信息庫(kù)簡(jiǎn)單,但它遠(yuǎn)沒(méi)有全基因組測(cè)序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫(kù)那么復(fù)雜;4)代謝物的種類(lèi)少,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡(jiǎn)單得多。5)代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類(lèi)似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類(lèi)似。
代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些?一般來(lái)說(shuō),代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對(duì)象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析,如某一類(lèi)結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類(lèi))或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析:同時(shí)對(duì)多個(gè)代謝物進(jìn)行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對(duì)生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對(duì)生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門(mén)學(xué)科。杭州脂質(zhì)代謝組學(xué)多技術(shù)分析
代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。濟(jì)南植物靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化,從中找出表達(dá)差異的代謝物,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過(guò)程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn)。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過(guò)采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實(shí)現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測(cè)和鑒定幾百至幾千種代謝物。濟(jì)南植物靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格