南京TMT／iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

蛋白組究竟研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達(dá)量與實(shí)際對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高，就簡(jiǎn)單地測(cè)試了酵母中mRNA和對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高，經(jīng)過(guò)平均后r值只為0.4。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質(zhì)定性，或者說(shuō)大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當(dāng)中；第2，蛋白質(zhì)定量，也就是大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)的含量（包括一定含量與相對(duì)含量）；第3，蛋白質(zhì)翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙?；鹊?，也包括對(duì)這些翻譯后修飾的定量研究。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對(duì)提高我國(guó)生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。南京TMT／iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)？大概可以測(cè)到多少的蛋白種類(lèi)？原則上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白組檢測(cè)。樣本測(cè)到的蛋白種類(lèi)跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān)，一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大，可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類(lèi)型有關(guān)，通常，組織細(xì)胞相比于體液樣本，能夠鑒定到更多的蛋白。蛋白組學(xué)樣本寄送前是否需要精確計(jì)數(shù)或是稱(chēng)量？不同樣本寄送會(huì)有不同的送樣要求，按照收集方法提供可以保證實(shí)驗(yàn)用量充足。不需要精確計(jì)數(shù)或是稱(chēng)量，項(xiàng)目開(kāi)展前會(huì)進(jìn)行蛋白濃度的測(cè)定，后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機(jī)檢測(cè)，但是要保證每個(gè)樣本的寄樣量達(dá)到實(shí)驗(yàn)要求。四川PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)價(jià)格蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來(lái)看），就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析。

DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：采集所有離子及碎片圖譜，重現(xiàn)性好?；谒槠x子定量，選擇性好，可媲美 SPM/MRM。循環(huán)時(shí)間固定，掃描點(diǎn)數(shù)均勻，定量準(zhǔn)確度高。高通量，能同時(shí)監(jiān)測(cè)所有目標(biāo)蛋白。PRM 靶向定量蛋白組：平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）是一種靶向檢測(cè)方法，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白、目標(biāo)肽段進(jìn)行選擇性檢測(cè)，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白/肽段進(jìn)行相對(duì)定量。技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：不依賴(lài)抗體；特異性；結(jié)果準(zhǔn)確、可靠；高通量。修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：利用 LC-MS/MS 結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)檢索的方法，在搜庫(kù)時(shí)設(shè)置修飾搜庫(kù)參數(shù)，實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)所有已知的修飾位點(diǎn)磷酸化、乙酰化、糖基化和泛素化進(jìn)行鑒定。

蛋白質(zhì)組研究?jī)?nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合Western等技術(shù)，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式，因此對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對(duì)闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。基-受體結(jié)合分析。可以利用基因敲除和反義技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來(lái)后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術(shù)。

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程是怎樣的？要做PRM首先要明確目標(biāo)蛋白（或多肽）是什么，設(shè)計(jì)和建立針對(duì)這些目標(biāo)蛋白PRM質(zhì)譜采集方法，然后對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行PRM數(shù)據(jù)采集，將得到的原始譜圖數(shù)據(jù)導(dǎo)入分析軟件提取子離子信息進(jìn)行定量。另外，如果配制已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)肽段，用PRM額外做一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)，即可實(shí)現(xiàn)一定的定量。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)能應(yīng)用到哪些方面？研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過(guò)PRM技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)。具體說(shuō)來(lái)，比如驗(yàn)證定量蛋白質(zhì)組學(xué)中某些蛋白的變化，多肽的相對(duì)和一定的定量，想做蛋白定量卻沒(méi)有抗體，針對(duì)蛋白修飾位點(diǎn)的定量，想同時(shí)定量多個(gè)蛋白的情況等，都可以用PRM來(lái)做。DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)可以采集所有離子及碎片圖譜，重現(xiàn)性好。北京TMT／iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)組學(xué)研究不僅是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類(lèi)健康事業(yè)帶來(lái)巨大的利益。南京TMT／iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)組學(xué)常用技術(shù)：非靶向蛋白組學(xué)：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學(xué)。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對(duì)象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍。蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線(xiàn)粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對(duì)象，通過(guò)對(duì)蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測(cè)蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測(cè)的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。南京TMT／iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)