浙江4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-29

蛋白質(zhì)組學(xué)研究這樣做:蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng),也是一個(gè)整體的概念,隨著基因組學(xué)研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點(diǎn),對蛋白組學(xué)的研究可以使我們更容易接近生命的機(jī)理本質(zhì),但探究成千上萬的蛋白質(zhì)特性也是一個(gè)重大的技術(shù)挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)組(Proteome)指的是某一時(shí)刻或某一狀態(tài)基因組表達(dá)的所有相應(yīng)的蛋白,即細(xì)胞、組織或機(jī)體全部蛋白質(zhì)的存在及活動(dòng)形式,其是一個(gè)動(dòng)態(tài)概念,它是在組織、細(xì)胞的整體蛋白質(zhì)水平上,探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機(jī)理、調(diào)節(jié)控制以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)的相互關(guān)系、從而獲得生命活動(dòng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的全方面而深入的認(rèn)識,以揭示生命活動(dòng)的基本規(guī)律。蛋白質(zhì)組研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律。浙江4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析:特點(diǎn):(1)不同樣本標(biāo)記之后混樣,統(tǒng)一處理上機(jī),減少了分別上機(jī)造成的實(shí)驗(yàn)誤差,并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測,定量更準(zhǔn)確,重復(fù)性更好;(2)由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記,因此成本相對較高;(3)通量高,在一次實(shí)驗(yàn)中比較多可同時(shí)比較8個(gè)樣品;(4)利用基于同一個(gè)參考樣品的辦法,可以進(jìn)行多于8個(gè)樣品的定量比較;(5)iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析:Label-Free定量,即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。浙江新型修飾蛋白組學(xué)一般流程蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。

iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組技術(shù)優(yōu)勢:1、結(jié)果可靠:基于高靈敏度和高分辨的串聯(lián)質(zhì)譜方法,定性與定量同步進(jìn)行,同時(shí)得出定性和定量結(jié)果,重復(fù)樣品間的蛋白表達(dá)量相關(guān)性高;2、靈敏度高:分級分離,降低樣品復(fù)雜度,相比凝膠電泳觀測到的蛋白變化在2倍以上,iTRAQ計(jì)算出的蛋白變化在1.3-1.6倍之間,可檢測低豐度蛋白;3、分離能力強(qiáng):可分離出酸/堿性蛋白,小于10KDa或大于200KDa的蛋白、難溶性蛋白等;4、自動(dòng)化程度高:液質(zhì)聯(lián)用,自動(dòng)化操作,分析速度快,分離效果好。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,各有優(yōu)勢和局限的特點(diǎn),而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強(qiáng)調(diào)各種方法間的整合和互補(bǔ),以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源,特別是,蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)??茖W(xué)如基因組學(xué),生物信息學(xué)等領(lǐng)域的交叉,構(gòu)成組學(xué)(omics)生物技術(shù)研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)(System Biology)研究模式,將成為未來生命科學(xué)比較令人激動(dòng)的新前沿。Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析。

蛋白質(zhì)組學(xué)介紹:蛋白質(zhì)組學(xué),指對某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)組主要通過蛋白質(zhì)雙向電泳、氨基酸序列測定、質(zhì)譜、生物信息等方法,研究某個(gè)基因組對應(yīng)的所有蛋白質(zhì)特征,包括蛋白質(zhì)含量、亞細(xì)胞定位、活性以及蛋白修飾等內(nèi)容。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢。蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)

對人類而言,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康。浙江4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時(shí)其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時(shí),通常需要將被檢測蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進(jìn)步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術(shù)可以直接對完整的蛋白質(zhì)進(jìn)行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。浙江4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)