蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,那些世界范圍內銷路比較好的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此,蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質組學技術有生物質譜。山東Label free非標記定量蛋白質組學服務
蛋白組學樣本寄送前是否需要精確計數或是稱量?不同樣本寄送會有不同的送樣要求,按照收集方法提供可以保證實驗用量充足。不需要精確計數或是稱量,項目開展前會進行蛋白濃度的測定,后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機檢測,但是要保證每個樣本的寄樣量達到實驗要求。常規(guī)定量蛋白組實驗的主要步驟有哪些,數據分析內容包含哪些?實驗步驟:首先獲得生物學樣本,然后進行蛋白提取,定量,SDS-PAGE跑膠質控,還原烷基化,酶解,獲得肽段,(標記+分組分),上機檢測,搜庫軟件搜庫,數據分析;數據分析:主要分為基礎數據分析、?級數據分析和個性化數據分析三個部分。基礎分析主要包括差異表達蛋白篩選、層次聚類分析分析、COG注釋分析、亞細胞定位分析、GO注釋富集分析、KEGG注釋分析、PPI分析等。山東Label free非標記定量蛋白質組學服務蛋白質組研究技術在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。
蛋白質組學描述: 蛋白質組(proteome):一種細胞、組織或生物體完整基因組所對應的全套蛋白質。蛋白質組學(proteomics):研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、變化、定位及相互作用規(guī)律的科學。蛋白質譜技術: 蛋白質譜技術是蛋白質鑒定分析的主要支撐技術,它通過測定樣品離子的質荷比(m/z) 來進行成分和結構分析。高靈敏度,精確度;能同時提供樣品的精確分子量和結構信息;既可用于定性分析,也可用于定量分析。標記定量技術原理: 在一級質譜圖中,任何一種iTRAQ/TMT試劑標記不同樣本中的同一蛋白質表現為相同的質荷比; 在二級質譜圖中,報告離子表現為不同質荷比的峰,因此根據波峰的高度及面積,可以鑒定出蛋白質和分析出同一蛋白質不同處理的定量信息。
蛋白質組學技術有什么?雙向凝膠電泳:雙向凝膠電泳的原理是第1向基于蛋白質的等電點不同用等電聚焦分離,第二向則按分子量的不同用SDS-PAGE分離,把復雜蛋白混合物中的蛋白質在二維平面上分開。由于雙向電泳技術在蛋白質組與醫(yī)學研究中所處的重要位置,它可用于蛋白質轉錄及轉錄后修飾研究,蛋白質組的比較和蛋白質間的相互作用,細胞分化凋亡研究,致病機制及耐藥機制的研究,療效監(jiān)測,新藥開發(fā),研究,蛋白純度檢查,小量蛋白純化,新替代疫苗的研制等許多方面。近年來經過多方面改進已成為研究蛋白質組的比較有使用價值的關鍵方法。Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析。
常用的定量蛋白質組學技術方法有以下幾類:非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術:Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據,比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。TMT定量蛋白組學技術:這種技術采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。蛋白質組和基因組在概念上有相關性。杭州PRM靶向定量蛋白質組學主要技術
蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標有效的方法之一。山東Label free非標記定量蛋白質組學服務
定量蛋白質組學方法學介紹:Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free定量不需要標記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復性要求較高,準確性也較標記定量差。因此,Label-free技術適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標記定量實現的實驗設計。山東Label free非標記定量蛋白質組學服務